More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3933 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3933  transport system permease protein  100 
 
 		 389 aa  727    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  80.11 
 
 		 371 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  42.51 
 
 		 346 aa  225  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  51.88 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  48.99 
 
 		 346 aa  223  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  45.15 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  45 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  48.96 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  48.62 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  48 
 
 		 346 aa  216  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  45.71 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.62 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  46.2 
 
 		 364 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  51 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.58 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  44.1 
 
 		 361 aa  193  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  43.29 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  43.44 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22090  ABC-type enterobactin transport system, permease component  48 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357226  normal  0.153637 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  40.58 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  38.73 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  37.71 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.69 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  41.58 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  41.46 
 
 		 394 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  44.21 
 
 		 347 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  38.92 
 
 		 350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  36.92 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  43.29 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  41.61 
 
 		 663 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  40.96 
 
 		 346 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  42.5 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  38.61 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  46.12 
 
 		 341 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  42.06 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  37.99 
 
 		 353 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  38.46 
 
 		 330 aa  156  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  40.35 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  34.5 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  45.14 
 
 		 346 aa  153  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  38.44 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  40.89 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  37.31 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  40.12 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  40.56 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  36.34 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22100  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.72 
 
 		 356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  38.41 
 
 		 343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  35.56 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  36.49 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  33.24 
 
 		 353 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4041  transport system permease protein  39.24 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  36.18 
 
 		 319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  40.83 
 
 		 356 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  38.57 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  41.07 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  38.57 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  37.19 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  38.57 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  38.23 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  38.23 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  45.24 
 
 		 353 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  39.25 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  39.25 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  39.25 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  39.25 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  37.88 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  37.88 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  36.03 
 
 		 350 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  37.05 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  37.4 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  38.91 
 
 		 329 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  41.62 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  34.43 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  34.02 
 
 		 351 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 352 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  43.89 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  40.75 
 
 		 371 aa  138  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  39.12 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  40.37 
 
 		 346 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  35.76 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  35.1 
 
 		 352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  38.91 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.39 
 
 		 644 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 352 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  35.83 
 
 		 338 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2493  transport system permease protein  36.5 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.357055 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  34.77 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.77 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.77 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  32.54 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  34.77 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  33.65 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  32.08 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  30.45 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  35.03 
 
 		 678 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  32.08 
 
 		 346 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  34.77 
 
 		 352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>