More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22090  ABC-type enterobactin transport system, permease component  100 
 
 
365 aa  684    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357226  normal  0.153637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  50.64 
 
 
371 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  41.31 
 
 
349 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  39.21 
 
 
346 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  41.94 
 
 
344 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4294  transport system permease protein  43.03 
 
 
364 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  41.95 
 
 
345 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3933  transport system permease protein  49.54 
 
 
389 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  40.37 
 
 
346 aa  182  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  43.73 
 
 
346 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  43.05 
 
 
346 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26530  ABC-type enterobactin transport system, permease component  46.88 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  44.04 
 
 
349 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  41.3 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.05 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.43 
 
 
368 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0426  transport system permease protein  35.69 
 
 
355 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.459391 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22100  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.48 
 
 
356 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  40.54 
 
 
356 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
358 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  37.24 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  37.32 
 
 
346 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  36.36 
 
 
363 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  28.27 
 
 
338 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  28.27 
 
 
338 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  38.24 
 
 
366 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  39.37 
 
 
366 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  36.3 
 
 
348 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  36.89 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06009  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  33.45 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  39.79 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  37.76 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  38.1 
 
 
350 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  36.43 
 
 
319 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  40.21 
 
 
343 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  38 
 
 
346 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  30.41 
 
 
352 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  34.01 
 
 
319 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  30.12 
 
 
352 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  38.87 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  29.59 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  29.91 
 
 
352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  29.91 
 
 
352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.78 
 
 
678 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  29.91 
 
 
352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  38.79 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
352 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  37.18 
 
 
344 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
352 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2173  transport system permease protein  42.18 
 
 
346 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0459545  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  37.09 
 
 
351 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  33.8 
 
 
365 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4637  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.78 
 
 
678 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  37.64 
 
 
373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  34.53 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  37.22 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  36.42 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  36.36 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4425  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 
678 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  36.94 
 
 
341 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4767  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 
678 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0918553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4642  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 
678 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  35.95 
 
 
355 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  34.56 
 
 
318 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  31.85 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4265  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.49 
 
 
678 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  37.55 
 
 
338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  30.24 
 
 
353 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  30.68 
 
 
372 aa  129  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0598  iron-hydroxamate transporter permease subunit  31.2 
 
 
678 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  37.28 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  29.41 
 
 
362 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  31.25 
 
 
383 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  34.2 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  38.36 
 
 
347 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  39.34 
 
 
343 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  27.59 
 
 
373 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  36.84 
 
 
371 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  38.74 
 
 
342 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  36.96 
 
 
345 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1808  transport system permease protein  37.5 
 
 
368 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.537054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  31.89 
 
 
343 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  34.9 
 
 
350 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  32.68 
 
 
365 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  37.21 
 
 
330 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  37.24 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  38.1 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  28.39 
 
 
340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  38.35 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  28.39 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  38.35 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  38.97 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  28.39 
 
 
340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  38.35 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3185  ferric enterobactin ABC transporter permease FepG  32.99 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0655779 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  38.71 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>