More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3534 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  100 
 
 		 350 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  61.03 
 
 		 348 aa  352  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  61.28 
 
 		 343 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  59.12 
 
 		 346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  56.27 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  48.22 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  53.1 
 
 		 346 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  50.3 
 
 		 350 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  52.17 
 
 		 347 aa  250  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  44.92 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  46.85 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  43.57 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  44.2 
 
 		 339 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  47.84 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  46.09 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  45.43 
 
 		 363 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  46.23 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  44.12 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  47.84 
 
 		 343 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  48.4 
 
 		 354 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  46.11 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  45.1 
 
 		 341 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.12 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  50 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  44.48 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.88 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  48.2 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  47.25 
 
 		 342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  46.65 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  43.5 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  43.5 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  43.5 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  43.5 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  47.29 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  43.2 
 
 		 329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  43.21 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  43.21 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  43.21 
 
 		 330 aa  189  8e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  43.25 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  43.25 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  43.56 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  43.96 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  42.9 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  42.9 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  40.82 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  43.52 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  43.05 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  41.41 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  40.2 
 
 		 355 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2087  transport system permease protein  41.23 
 
 		 349 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0285483  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  41.67 
 
 		 663 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  36.98 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.12 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  39.62 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  37.98 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  37.81 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  42.02 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  44.77 
 
 		 341 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  35.67 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  38.04 
 
 		 360 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  41.43 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  40.06 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3333  ABC transporter related  38.83 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237687  normal  0.164593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  37.69 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  38.32 
 
 		 336 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  38.73 
 
 		 350 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.22 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  34.54 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  32.83 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  32.83 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  32.83 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.83 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  32.83 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2582  transport system permease protein  40.33 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  35.39 
 
 		 346 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 		 352 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  41.9 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  38.08 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  43 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 352 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  32.05 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  32.05 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  31.58 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  39.34 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  32.05 
 
 		 352 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3524  transport system permease protein  39.87 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3059  transport system permease protein  40.32 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.128595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 352 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  32.6 
 
 		 352 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3069  ferric enterobactin transport system permease protein FepG  43.91 
 
 		 346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.605614  normal  0.369476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  31.95 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  32.74 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  37.32 
 
 		 352 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3733  transport system permease protein  39.93 
 
 		 371 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  32.74 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  33.04 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>