More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2422 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2422  transport system permease protein  100 
 
 		 355 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000852426  normal  0.0155249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1622  transport system permease protein  45.86 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1325  transport system permease protein  49.83 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0994894  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1121  iron-enterobactin transporter permease  45.2 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37310  ABC-type enterobactin transport system, permease component  52.91 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3731  transport system permease protein  49.83 
 
 		 339 aa  232  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1496  transport system permease protein  46.56 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5946  transport system permease protein  46.55 
 
 		 356 aa  229  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.24469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0307  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 358 aa  229  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3784  transport system permease protein  42.31 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0674  iron-enterobactin transporter permease  46.15 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00556  iron-enterobactin transporter subunit  46.15 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.969971  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0337  ABC-type enterobactin transport system inner membrane subunit  45.4 
 
 		 346 aa  223  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00545  hypothetical protein  46.15 
 
 		 330 aa  222  6e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3037  transport system permease protein  46.15 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0491  iron-enterobactin transporter permease  46.15 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0609  iron-enterobactin transporter permease  46.15 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3055  iron-enterobactin transporter permease  46.15 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0640  iron-enterobactin transporter permease  46.15 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1240  transport system permease protein  47.59 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103412  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2747  transport system permease protein  44.92 
 
 		 353 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168539  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20800  ABC-type enterobactin transport system, permease component  45.08 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0161393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02580  ABC-type enterobactin transport system, permease component  42.9 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.549051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0609  iron-enterobactin transporter permease  46.46 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0687  iron-enterobactin transporter permease  46.56 
 
 		 329 aa  212  7.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.931456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0630  iron-enterobactin transporter permease  46.56 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0644  iron-enterobactin transporter permease  46.56 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0749  iron-enterobactin transporter permease  46.56 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0703  iron-enterobactin transporter permease  46.3 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4082  transport system permease protein  41.09 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.08527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3466  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  44.34 
 
 		 368 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1806  transport system permease protein  44.71 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1629  transport system permease protein  43.23 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.286622  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2205  transport system permease protein  43.12 
 
 		 363 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.264091  hitchhiker  0.000202612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4299  transport system permease protein  45.1 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352275  decreased coverage  0.0000200098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2721  transport system permease protein  42.18 
 
 		 338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0141  transport system permease protein  41.57 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5110  iron-enterobactin transporter permease  43.2 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3046  transport system permease protein  46.42 
 
 		 663 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3425  iron-enterobactin transporter permease  46.41 
 
 		 341 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0645  transport system permease protein  44.14 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5054  transport system permease protein  45.56 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4290  transport system permease protein  47.13 
 
 		 350 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36330  ABC-type enterobactin transport system, permease component  47.94 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2690  transport system permease protein  42.94 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.027159  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7987  ferric enterobactin transport protein FepG  43.17 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.333013  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0332  transport system permease protein  45.48 
 
 		 394 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0357  transport system permease protein  46.73 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3757  transport system permease protein  44.17 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.236422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2554  transport system permease protein  46.08 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734502  normal  0.754642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5335  transport system permease protein  41.35 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3534  transport system permease protein  40.83 
 
 		 350 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3152  transport system permease protein  43.58 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000309752  hitchhiker  0.000000000937793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2439  transport system permease protein  46.05 
 
 		 353 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.107589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2743  transport system permease protein  46.69 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00380134  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2817  transport system permease protein  37.72 
 
 		 336 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1449  transport system permease protein  42.17 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.574166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0852  iron-enterobactin transporter permease  42.17 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.852286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10140  ferric enterobactin transport protein FepG  44.34 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00034947  normal  0.925248 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3638  transport system permease protein  34.19 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0879302  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  32.14 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3139  transport system permease protein  37.76 
 
 		 345 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00243696  normal  0.0777655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19100  ABC-type enterobactin transport system, permease component  38.28 
 
 		 356 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.158875 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  33.84 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  33.23 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 338 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  33.03 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  33.03 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  33.03 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4232  transport system permease protein  42.55 
 
 		 347 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  32.93 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  32.73 
 
 		 338 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06490  ABC-type enterobactin transport system, permease component  43.09 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.830373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2825  transport system permease protein  35.62 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1776  iron compound ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  33.65 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  34.95 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  35.76 
 
 		 326 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  32.32 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  32.1 
 
 		 340 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  31.45 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2319  transport system permease protein  39.25 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  29.52 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  29.52 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3414  ABC Fe+3-siderophore transporter, inner membrane subunit  37.83 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  31.8 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  31.19 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  31.19 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  31.19 
 
 		 340 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  31.19 
 
 		 340 aa  146  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  28.48 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3527  transport system permease protein  36.95 
 
 		 347 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.369095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  28.17 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  35.65 
 
 		 350 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  30.13 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>