More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1041 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1041  transport system permease protein  100 
 
 
348 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0685  iron compound ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 
352 aa  285  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0583  iron compound ABC transporter permease  47.25 
 
 
352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  47.25 
 
 
352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000106314  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0617  iron compound ABC transporter permease protein  47.25 
 
 
352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0527  iron(III) dicitrate ABC transporter, permease  47.25 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0672  iron compound ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75136e-27 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0745  iron compound ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 
352 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0654  iron compound ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 
352 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0531  transport system permease protein  46.6 
 
 
352 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00495047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4683  iron compound ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 
352 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.106219  hitchhiker  2.60339e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2266  transport system permease protein  50.32 
 
 
350 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0465  transport system permease protein  53.72 
 
 
343 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1985  transport system permease protein  50.34 
 
 
348 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1525  transport system permease protein  51.34 
 
 
343 aa  258  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  42.94 
 
 
338 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  42.94 
 
 
338 aa  251  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  43.27 
 
 
338 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  42.95 
 
 
338 aa  250  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  42.94 
 
 
338 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  42.94 
 
 
338 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  42.94 
 
 
338 aa  249  4e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  42.94 
 
 
338 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  42.94 
 
 
338 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2938  transport system permease protein  53.31 
 
 
343 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2668  transport system permease protein  50.82 
 
 
349 aa  243  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2592  transport system permease protein  51 
 
 
343 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  42.95 
 
 
338 aa  242  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  42.64 
 
 
338 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5747  transport system permease protein  41.61 
 
 
353 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0415  transport system permease protein  47.57 
 
 
346 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  42.95 
 
 
351 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0104  transport system permease protein  38.67 
 
 
332 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000364541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0100  transport system permease protein  38.67 
 
 
332 aa  227  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0102196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2436  transport system permease protein  42.15 
 
 
344 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  unclonable  0.000000000541078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  37.89 
 
 
337 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3486  iron compound ABC transporter, permease protein  36.87 
 
 
338 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00341334  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  37.58 
 
 
337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3189  iron compound ABC transporter, permease  36.87 
 
 
338 aa  222  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1775  iron compound ABC transporter, permease protein  37.24 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000327409  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3502  iron compound ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3276  iron compound ABC transporter permease  36.28 
 
 
338 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3533  iron compound ABC transporter permease protein  36.28 
 
 
338 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3490  iron compound ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
338 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3246  iron compound ABC transporter, permease  35.99 
 
 
338 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3473  iron compound ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
338 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3036  transport system permease protein  41.9 
 
 
346 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3085  transport system permease protein  41.9 
 
 
346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.543898  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3186  transport system permease protein  37.58 
 
 
338 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  34.91 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  34.91 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1464  iron compound ABC transporter, permease protein  35.12 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  35.63 
 
 
340 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3835  iron compound ABC transporter, permease protein  34.82 
 
 
340 aa  212  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3785  iron compound ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
340 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0901363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3581  iron compound ABC transporter permease  34.32 
 
 
340 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  34.32 
 
 
340 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  34.62 
 
 
340 aa  208  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3747  iron compound ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
340 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000151165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3865  iron compound ABC transporter permease protein  34.32 
 
 
340 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
342 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3493  iron compound ABC transporter, permease  34.32 
 
 
340 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  37.5 
 
 
345 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  34.04 
 
 
340 aa  205  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  37.38 
 
 
342 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  37.95 
 
 
332 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0780  iron compound ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
340 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.198362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  37.19 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  37.19 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  37.19 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  37.05 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  36.68 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  36.88 
 
 
342 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1047  transport system permease protein  39.21 
 
 
329 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7289  ABC transporter  46.13 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  38.74 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  40.6 
 
 
354 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4922  iron compound ABC transporter, permease protein  39.66 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311941  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2124  transport system permease protein  41.94 
 
 
332 aa  195  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.105948  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  39.02 
 
 
319 aa  194  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2206  transport system permease protein  37.96 
 
 
322 aa  193  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.690044  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2244  transport system permease protein  37.96 
 
 
322 aa  193  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0779232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3320  iron ABC transporter, permease protein FitD  42.35 
 
 
349 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0698736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  38.93 
 
 
358 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1775  iron compound ABC transporter, permease protein  36.5 
 
 
321 aa  192  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.37 
 
 
325 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2014  transport system permease protein  44.52 
 
 
351 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0151588  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  36.52 
 
 
376 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3086  transport system permease protein  39.1 
 
 
322 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344068  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4340  iron ABC transporter, permease protein FitD  41.64 
 
 
345 aa  191  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0329  transport system permease protein  38.98 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0214  iron chelate ABC transporter permease protein  35.15 
 
 
328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2493  transport system permease protein  40.85 
 
 
325 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.357055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3035  transport system permease protein  39.05 
 
 
322 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  40.93 
 
 
352 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0321  ferrichrome transport system permease  38.19 
 
 
335 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2828  iron-hydroxamate transporter permease subunit  41.58 
 
 
644 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.633423  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4357  iron-hydroxamate transporter permease subunit  36.04 
 
 
678 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  37.54 
 
 
367 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>