More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf743 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf743  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 419 aa  867    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 423 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  54.39 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02911  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 423 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  54.88 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  56.76 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  55.06 
 
 		 416 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  56.02 
 
 		 413 aa  471  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  55.2 
 
 		 427 aa  471  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  55.31 
 
 		 417 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  52.8 
 
 		 425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1185  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.961366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1344  serine hydroxymethyltransferase  55.06 
 
 		 417 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.538197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0461  serine hydroxymethyltransferase  55.15 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl106  serine hydroxymethyltransferase  56.68 
 
 		 412 aa  463  1e-129  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  55.15 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 410 aa  464  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1094  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1887  Glycine hydroxymethyltransferase  52.84 
 
 		 419 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  52.62 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  53.38 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0489  serine hydroxymethyltransferase  56.33 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 417 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 418 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  53.48 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1160  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  53.48 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0322  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457346  decreased coverage  0.0000286459 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1660  serine hydroxymethyltransferase  53.68 
 
 		 418 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  52.9 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0451  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 414 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178848  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3471  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  52.28 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  53.43 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3305  serine hydroxymethyltransferase  53.69 
 
 		 417 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.297219  hitchhiker  0.000907019 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0226  serine hydroxymethyltransferase  54.95 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.667379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2780  serine hydroxymethyltransferase  54.19 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0344  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.963128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1142  serine hydroxymethyltransferase  53.01 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.510367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1094  serine hydroxymethyltransferase  53.69 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.383314 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1209  serine hydroxymethyltransferase  53.69 
 
 		 417 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3161  serine hydroxymethyltransferase  53.94 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.261571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1555  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 414 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0345  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 417 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.911009 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  52.66 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1014  serine hydroxymethyltransferase  53.69 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1647  serine hydroxymethyltransferase  54.7 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  51.73 
 
 		 427 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  52.94 
 
 		 419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5208  serine hydroxymethyltransferase  53.68 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04405  serine hydroxymethyltransferase  52.2 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  53.16 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1093  serine hydroxymethyltransferase  53.2 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0417  serine hydroxymethyltransferase  54.9 
 
 		 420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3044  serine hydroxymethyltransferase  53.45 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.196975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3162  serine hydroxymethyltransferase  53.69 
 
 		 417 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.911286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2762  serine hydroxymethyltransferase  53.2 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1231  serine hydroxymethyltransferase  53.2 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0425  serine hydroxymethyltransferase  54.3 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0460217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  54.07 
 
 		 419 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  53.92 
 
 		 417 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  53.68 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 412 aa  450  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2927  serine hydroxymethyltransferase  51.85 
 
 		 415 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  53.47 
 
 		 411 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  50.98 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  53.22 
 
 		 466 aa  448  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  53.47 
 
 		 411 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  51.91 
 
 		 423 aa  449  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  54.17 
 
 		 427 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0455  serine hydroxymethyltransferase  54.27 
 
 		 411 aa  450  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0075  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 413 aa  451  1e-125  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  53.64 
 
 		 417 aa  450  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  54.28 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2807  serine hydroxymethyltransferase  54.19 
 
 		 418 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0316342  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1033  serine hydroxymethyltransferase  53.45 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33010  serine hydroxymethyltransferase  54.43 
 
 		 418 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.821039  hitchhiker  0.000096337 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  51.6 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  52.23 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.45 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  54.41 
 
 		 417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  52.39 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0575  Glycine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 415 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00199338  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1627  serine hydroxymethyltransferase  56.13 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  51.6 
 
 		 425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0617  serine hydroxymethyltransferase  54.81 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 411 aa  445  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>