More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5632 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5632  transcriptional regulator  100 
 
 		 472 aa  929    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3960  transcriptional regulator  56.48 
 
 		 586 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473267 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5165  GntR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.469019 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6135  GntR family transcriptional regulator  53.32 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1062  MocR family transcriptional regulator  56.05 
 
 		 473 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6386  GntR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 470 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.157204 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6089  transcriptional regulator  54.09 
 
 		 470 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3552  transcriptional regulator  53.78 
 
 		 469 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6987  transcriptional regulator  53.33 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2903  GntR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 497 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4344  GntR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 476 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266344  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3945  transcriptional regulator  40.6 
 
 		 476 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.24 
 
 		 471 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3074  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 470 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3915  transcriptional regulator, GntR family  38.08 
 
 		 444 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0753496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2793  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.102841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3107  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 478 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.936861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.32 
 
 		 472 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  35.22 
 
 		 476 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5788  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 496 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1580  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2985  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 444 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.12333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3108  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 444 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.552212  normal  0.675979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2950  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 		 444 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130328  normal  0.0175968 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2919  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.39 
 
 		 444 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5644  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.09 
 
 		 481 aa  265  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3002  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 444 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227723 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0024  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.5 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0173306 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5559  transcriptional regulator  35.51 
 
 		 498 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4350  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.64 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.73766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 507 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.47 
 
 		 514 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 507 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 507 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 507 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 511 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4072  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 458 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 501 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3492  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.249903  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 507 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 507 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1588  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 485 aa  244  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104897  hitchhiker  0.00377444 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 509 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  35.01 
 
 		 506 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0497  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 463 aa  243  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.283703 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 506 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 492 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 506 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 502 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 497 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.53 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1952  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00720437  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5258  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 502 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 569 aa  236  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  37.47 
 
 		 502 aa  236  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 513 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  35.77 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.45 
 
 		 497 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 516 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.68 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.71 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 520 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 502 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 509 aa  230  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.1 
 
 		 495 aa  229  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  33.2 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.82 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  34.61 
 
 		 507 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 521 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.29 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 495 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  32.72 
 
 		 499 aa  227  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  33 
 
 		 509 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.26 
 
 		 497 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.95 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  33.4 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  30.93 
 
 		 485 aa  223  6e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.41 
 
 		 485 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 502 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0661  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3005  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  33.33 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 493 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.45 
 
 		 501 aa  221  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 508 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>