More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5338 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1245  glycosyl transferase family protein  66.84 
 
 		 1062 aa  703    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.98535  normal  0.350784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0314  glycosyl transferase family protein  69.5 
 
 		 1011 aa  1369    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1192  glycosyl transferase family 51  68.09 
 
 		 1015 aa  1360    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557434  normal  0.718287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5338  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 1037 aa  2074    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5858  glycosyl transferase family 51  87.68 
 
 		 991 aa  1753    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1407  glycosyl transferase family 51  67.58 
 
 		 1017 aa  1347    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0112759 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  35.44 
 
 		 819 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  35.71 
 
 		 819 aa  399  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 819 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 		 818 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  34.98 
 
 		 809 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  34.95 
 
 		 819 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  33.78 
 
 		 805 aa  365  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  35.21 
 
 		 845 aa  357  7.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  34.69 
 
 		 832 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  33.21 
 
 		 830 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  32.85 
 
 		 854 aa  341  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  31.8 
 
 		 804 aa  339  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  32.93 
 
 		 830 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  32.15 
 
 		 795 aa  331  5.0000000000000004e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  34.1 
 
 		 773 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  34.48 
 
 		 807 aa  322  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  33.11 
 
 		 807 aa  320  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  30.78 
 
 		 841 aa  319  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  32.24 
 
 		 800 aa  318  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  30.89 
 
 		 829 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  30.65 
 
 		 818 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  31.91 
 
 		 805 aa  302  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  32.67 
 
 		 862 aa  302  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  33 
 
 		 904 aa  298  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  29.7 
 
 		 748 aa  292  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  31.35 
 
 		 852 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  31.86 
 
 		 803 aa  289  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  31.12 
 
 		 852 aa  288  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  30.76 
 
 		 852 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 846 aa  286  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  31.59 
 
 		 852 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  31.09 
 
 		 807 aa  284  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  30.67 
 
 		 812 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  29.36 
 
 		 849 aa  271  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  28.74 
 
 		 839 aa  264  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  28.47 
 
 		 835 aa  254  6e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  28.45 
 
 		 832 aa  245  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  30.76 
 
 		 825 aa  225  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  35.37 
 
 		 808 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  35.15 
 
 		 805 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  36.4 
 
 		 804 aa  216  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  35.29 
 
 		 805 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  37.97 
 
 		 840 aa  215  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  35.31 
 
 		 833 aa  211  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  36.39 
 
 		 810 aa  211  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  37.02 
 
 		 818 aa  210  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  39.29 
 
 		 818 aa  208  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  41.88 
 
 		 833 aa  207  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 817 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  40.67 
 
 		 797 aa  207  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  42.18 
 
 		 823 aa  204  5e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  37.82 
 
 		 827 aa  204  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  38.67 
 
 		 802 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  39.35 
 
 		 796 aa  202  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  33.03 
 
 		 804 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  33.26 
 
 		 830 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  40.91 
 
 		 796 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  34.17 
 
 		 835 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  33.41 
 
 		 831 aa  198  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  41.22 
 
 		 824 aa  198  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  41.18 
 
 		 849 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  41.03 
 
 		 843 aa  196  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  39.38 
 
 		 790 aa  195  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  40.62 
 
 		 803 aa  195  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  35.77 
 
 		 777 aa  194  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  35.77 
 
 		 777 aa  194  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  41.04 
 
 		 849 aa  194  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  41.04 
 
 		 849 aa  194  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.04 
 
 		 835 aa  192  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  37.43 
 
 		 796 aa  192  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  36.67 
 
 		 831 aa  192  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  38.24 
 
 		 799 aa  193  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  38.24 
 
 		 799 aa  192  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  42.04 
 
 		 908 aa  189  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  37.94 
 
 		 797 aa  189  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 838 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  40.07 
 
 		 766 aa  188  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  40.14 
 
 		 776 aa  188  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  36.47 
 
 		 801 aa  188  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  39.27 
 
 		 746 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  39.27 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  39.78 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  39 
 
 		 851 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  34.02 
 
 		 791 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  42.4 
 
 		 755 aa  185  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  39.17 
 
 		 802 aa  185  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  35.52 
 
 		 797 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  35.52 
 
 		 797 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  35.34 
 
 		 795 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  35.34 
 
 		 797 aa  184  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  38.91 
 
 		 705 aa  183  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  38.91 
 
 		 705 aa  183  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 		 797 aa  184  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  36.63 
 
 		 796 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>