More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1407 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5338  glycosyl transferase family protein  76.7 
 
 		 1037 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.082468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1192  glycosyl transferase family 51  93.53 
 
 		 1015 aa  1881    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557434  normal  0.718287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1407  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 1017 aa  2054    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0112759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5858  glycosyl transferase family 51  69.42 
 
 		 991 aa  1348    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0314  glycosyl transferase family protein  74.47 
 
 		 1011 aa  1491    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1245  glycosyl transferase family protein  96.66 
 
 		 1062 aa  1924    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.98535  normal  0.350784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  35.04 
 
 		 819 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  34.93 
 
 		 819 aa  394  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  34.93 
 
 		 819 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  34.65 
 
 		 818 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  34.06 
 
 		 805 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  34.1 
 
 		 804 aa  373  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 810 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  32.93 
 
 		 808 aa  366  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  33.29 
 
 		 805 aa  364  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  34.02 
 
 		 833 aa  363  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  34.38 
 
 		 832 aa  363  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  33.58 
 
 		 809 aa  363  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  34.02 
 
 		 805 aa  362  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  33.53 
 
 		 854 aa  361  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  33.59 
 
 		 818 aa  361  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 817 aa  361  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  34.11 
 
 		 831 aa  360  8e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  34.98 
 
 		 845 aa  360  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 833 aa  357  3.9999999999999996e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  33.51 
 
 		 849 aa  357  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  33.17 
 
 		 830 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  34.17 
 
 		 843 aa  357  6.999999999999999e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  33.38 
 
 		 823 aa  357  7.999999999999999e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  34.04 
 
 		 804 aa  357  7.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.57 
 
 		 835 aa  354  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 791 aa  354  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  32.77 
 
 		 831 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 		 819 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  33.09 
 
 		 830 aa  351  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  34.32 
 
 		 840 aa  350  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  33.63 
 
 		 849 aa  349  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  33.63 
 
 		 849 aa  348  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  33.17 
 
 		 830 aa  347  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  32.68 
 
 		 835 aa  347  8.999999999999999e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  35.07 
 
 		 802 aa  346  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  32.57 
 
 		 804 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  35.29 
 
 		 797 aa  344  5e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  31.44 
 
 		 803 aa  342  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  33.49 
 
 		 908 aa  339  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  34.02 
 
 		 793 aa  333  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 824 aa  330  6e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 807 aa  330  9e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  33.84 
 
 		 818 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  33.16 
 
 		 773 aa  328  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  34.71 
 
 		 797 aa  327  5e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  33.42 
 
 		 794 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  33.92 
 
 		 837 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  33.42 
 
 		 779 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  33.47 
 
 		 839 aa  322  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  33.47 
 
 		 839 aa  322  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  33.47 
 
 		 839 aa  322  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 838 aa  321  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  33.65 
 
 		 797 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  32.46 
 
 		 827 aa  320  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  33.65 
 
 		 797 aa  320  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  33.74 
 
 		 830 aa  319  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  32.98 
 
 		 838 aa  319  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  32.02 
 
 		 841 aa  319  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  34.21 
 
 		 792 aa  319  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  33.51 
 
 		 797 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  32.55 
 
 		 829 aa  318  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  32.97 
 
 		 807 aa  318  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  32.94 
 
 		 796 aa  318  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 777 aa  317  6e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 777 aa  317  6e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  33.02 
 
 		 839 aa  317  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  33.24 
 
 		 797 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  33.2 
 
 		 840 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  34.33 
 
 		 839 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  33.82 
 
 		 791 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 766 aa  314  4.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  31.51 
 
 		 804 aa  313  9e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  31.34 
 
 		 818 aa  313  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  33.24 
 
 		 795 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 797 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 904 aa  311  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  32.91 
 
 		 801 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  32.88 
 
 		 840 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  33.43 
 
 		 846 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  32.88 
 
 		 840 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  32.88 
 
 		 840 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  31.68 
 
 		 852 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  34.69 
 
 		 802 aa  308  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  32.74 
 
 		 852 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 800 aa  307  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 840 aa  307  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  32.06 
 
 		 790 aa  307  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 840 aa  307  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  32.92 
 
 		 796 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  34.1 
 
 		 799 aa  306  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 793 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  31.37 
 
 		 862 aa  305  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  32.47 
 
 		 852 aa  304  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  32.52 
 
 		 846 aa  303  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>