179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1783 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 227 aa  472  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  44.13 
 
 		 261 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  42.45 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.19 
 
 		 218 aa  178  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  43.58 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.78 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  43.19 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  43.19 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  43.19 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.01 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  41.56 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.92 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  41.59 
 
 		 243 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  39.55 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.81 
 
 		 243 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  37.61 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.89 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  40.78 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  40.19 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.05 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.62 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  39.17 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.5 
 
 		 254 aa  148  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  38.5 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  37.73 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.56 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  35.65 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.62 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  33.78 
 
 		 744 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.94 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  34.88 
 
 		 241 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  34.7 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  35.38 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  35.38 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  35.35 
 
 		 250 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.26 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  36.02 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.52 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  31.82 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.76 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.76 
 
 		 264 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.2 
 
 		 262 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  35.65 
 
 		 270 aa  115  3.9999999999999997e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  30.45 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  29.55 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.82 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  29.3 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  35.32 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  29.82 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  29.36 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  29.36 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  28.94 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.7 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  27.49 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  28.5 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  26.76 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  26.29 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  28.57 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.94 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  24.89 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  25.57 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  27.65 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  27.65 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  25.81 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  28.65 
 
 		 518 aa  62.4  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  26.56 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  27.32 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  32.26 
 
 		 509 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  28.19 
 
 		 520 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  31.25 
 
 		 484 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12371  cobyric acid synthase CobB  27.61 
 
 		 494 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.282998  normal  0.0311609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  34.15 
 
 		 496 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  28.18 
 
 		 498 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  35.71 
 
 		 541 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  35.71 
 
 		 541 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  31.01 
 
 		 505 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  26.57 
 
 		 563 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  28.91 
 
 		 527 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  35.71 
 
 		 541 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  35.71 
 
 		 560 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  23.38 
 
 		 490 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  23.38 
 
 		 490 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  26.47 
 
 		 536 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  34.48 
 
 		 508 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  31.3 
 
 		 529 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  28.46 
 
 		 556 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  31.45 
 
 		 512 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  34.09 
 
 		 554 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  33.33 
 
 		 510 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  31.9 
 
 		 481 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  31.21 
 
 		 495 aa  49.3  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  31.9 
 
 		 481 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  34.52 
 
 		 526 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  30.95 
 
 		 509 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  25.83 
 
 		 514 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  34.52 
 
 		 565 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  27.27 
 
 		 478 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  26.45 
 
 		 488 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  29.84 
 
 		 510 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  25.71 
 
 		 538 aa  48.1  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>