138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0449 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  51.85 
 
 		 243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  56.28 
 
 		 262 aa  263  1e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  55.56 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  54.04 
 
 		 244 aa  261  4.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  50.93 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  54.3 
 
 		 243 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  54.3 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  49.28 
 
 		 218 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  47.75 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.96 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  47.09 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.8 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  43.05 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  42.04 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  45.29 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  46.61 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.54 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  41.78 
 
 		 245 aa  178  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.36 
 
 		 248 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  43.58 
 
 		 227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.46 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  41.43 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.08 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.38 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  45.54 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.09 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  44.86 
 
 		 243 aa  157  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  44.86 
 
 		 243 aa  157  9e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.25 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  41.67 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  38.2 
 
 		 744 aa  152  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  38.53 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  38.98 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.51 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  38.46 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.67 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.26 
 
 		 264 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.26 
 
 		 264 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.5 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.44 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  37.85 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  35.53 
 
 		 231 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.72 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  34.91 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  36.17 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  33.62 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.09 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  34.09 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  33.64 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.96 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  34.13 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  34.7 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  31.88 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.88 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  35.51 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  36.15 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  30.88 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.34 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  28.76 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  29.31 
 
 		 512 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  31.36 
 
 		 516 aa  55.8  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  31.09 
 
 		 787 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  34.09 
 
 		 494 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  29.17 
 
 		 532 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  32.26 
 
 		 511 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  34.74 
 
 		 527 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  26.74 
 
 		 525 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  36.57 
 
 		 492 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  26.49 
 
 		 517 aa  48.9  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  30.3 
 
 		 501 aa  48.9  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  33.05 
 
 		 481 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  27.18 
 
 		 494 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  29.05 
 
 		 486 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  27.05 
 
 		 488 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  28.69 
 
 		 484 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  29.37 
 
 		 465 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1066  cobyric acid synthase  33.33 
 
 		 503 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.641596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  26.78 
 
 		 772 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  27.27 
 
 		 534 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  31.09 
 
 		 490 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  35.07 
 
 		 492 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  26.79 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  26.9 
 
 		 524 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  28.69 
 
 		 492 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  26.74 
 
 		 525 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  32.2 
 
 		 490 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  30 
 
 		 496 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  30.7 
 
 		 512 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  32.17 
 
 		 481 aa  45.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  29.08 
 
 		 518 aa  45.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  24.53 
 
 		 514 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  32.17 
 
 		 481 aa  45.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  29.31 
 
 		 480 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5369  cobyric acid synthase  31.52 
 
 		 491 aa  45.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  30.34 
 
 		 510 aa  45.4  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>