100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6530 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 250 aa  487  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  79.03 
 
 		 247 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  47.18 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  49.56 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  49.12 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.31 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  47.83 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.6 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  47.98 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  48.71 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.75 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.31 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  47.08 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  46.09 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  44.44 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  44.86 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  44.44 
 
 		 238 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  45.27 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  44.59 
 
 		 239 aa  168  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.53 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.81 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  34.75 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.16 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.68 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.17 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  40.08 
 
 		 270 aa  138  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.59 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  38.71 
 
 		 744 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.75 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  37.7 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.51 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  33.91 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  33.91 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  34.4 
 
 		 240 aa  129  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  33.48 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  33.9 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.64 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  35.44 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.41 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.25 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  31.65 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  31.65 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  31.82 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  31.82 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.47 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  36.05 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  31.02 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  30.95 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.19 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  31.25 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  30.88 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  30.52 
 
 		 261 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  30.09 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  31.25 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  30.42 
 
 		 264 aa  98.6  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  31.51 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  35.48 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  30.88 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.91 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.91 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.96 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  29.52 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  28.76 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  25.78 
 
 		 227 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  37.5 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  37.5 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  34.46 
 
 		 483 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  26.67 
 
 		 465 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  24.88 
 
 		 507 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  29.79 
 
 		 501 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  36.36 
 
 		 480 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  31.25 
 
 		 484 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  32.11 
 
 		 489 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  28.31 
 
 		 480 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  33.16 
 
 		 485 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  26.63 
 
 		 492 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  34.35 
 
 		 787 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  33.14 
 
 		 500 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  32.4 
 
 		 516 aa  45.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  29.67 
 
 		 514 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  30.81 
 
 		 524 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  32.08 
 
 		 485 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  32.29 
 
 		 484 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  32.76 
 
 		 488 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  26.06 
 
 		 492 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  26.78 
 
 		 527 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  28.89 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  32.57 
 
 		 500 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  31.82 
 
 		 488 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  31.58 
 
 		 483 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  32.17 
 
 		 538 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  31.25 
 
 		 480 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  25.26 
 
 		 534 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  24.84 
 
 		 541 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  28.27 
 
 		 481 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  28.57 
 
 		 481 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  26.39 
 
 		 534 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  28.57 
 
 		 481 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  30.46 
 
 		 490 aa  42.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  30.22 
 
 		 494 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>