115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2307 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  83.61 
 
 		 254 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  54.66 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  50.41 
 
 		 264 aa  254  9e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  47.72 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  50.44 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  46.25 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.21 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.98 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  39.41 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  40.76 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.01 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  39.41 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  45.07 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.39 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.78 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.91 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.26 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.06 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.93 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.79 
 
 		 251 aa  168  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  39.74 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  40.32 
 
 		 272 aa  161  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  43.54 
 
 		 241 aa  158  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.31 
 
 		 262 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  40.83 
 
 		 744 aa  158  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.14 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  41.12 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.92 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.92 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  37.69 
 
 		 270 aa  155  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.49 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  38.53 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  39.17 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  36.09 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  36.09 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  40.19 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  40 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  35.59 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.53 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  39.53 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  40 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.98 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  35.84 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  35.21 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.28 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  34.17 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.58 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  38.43 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  35.32 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  37.09 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.19 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.43 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  35.05 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.03 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  35.27 
 
 		 235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  34.86 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.71 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  34.26 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  34.58 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  35.05 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 247 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.1 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.23 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  29.41 
 
 		 492 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  32.72 
 
 		 512 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  31.75 
 
 		 512 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  29.41 
 
 		 492 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  31.43 
 
 		 518 aa  52.8  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  31.07 
 
 		 520 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  30.04 
 
 		 480 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  30 
 
 		 484 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5212  cobyric acid synthase CobQ  29.53 
 
 		 538 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  31.88 
 
 		 480 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  33.62 
 
 		 787 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  28.75 
 
 		 488 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  32.74 
 
 		 499 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  31.19 
 
 		 477 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  30.77 
 
 		 525 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  29.19 
 
 		 524 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  31.75 
 
 		 491 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  31.82 
 
 		 517 aa  45.4  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  30.87 
 
 		 465 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  30.18 
 
 		 532 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  31.85 
 
 		 506 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  31.82 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  31.85 
 
 		 483 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  32.58 
 
 		 503 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  30.06 
 
 		 481 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  33.33 
 
 		 494 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  29.69 
 
 		 496 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  32.08 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  31.06 
 
 		 488 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  29.03 
 
 		 489 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  35 
 
 		 490 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  28.95 
 
 		 484 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  28.92 
 
 		 488 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  27.8 
 
 		 487 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0462  cobyric acid synthase  29.95 
 
 		 492 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0586994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>