216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0012 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  60.52 
 
 
237 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  50.98 
 
 
254 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.03 
 
 
243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  50 
 
 
243 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  47.58 
 
 
241 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  53.3 
 
 
243 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  53.3 
 
 
243 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.5 
 
 
243 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  52.36 
 
 
241 aa  221  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  44.08 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  46.03 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  42.56 
 
 
245 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  47.97 
 
 
243 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  44.86 
 
 
250 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  49.36 
 
 
243 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  50 
 
 
255 aa  215  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  47.3 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  47.97 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.59 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  46.61 
 
 
241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.71 
 
 
262 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  44.22 
 
 
744 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.31 
 
 
264 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.31 
 
 
264 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.56 
 
 
248 aa  201  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  42.35 
 
 
270 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.34 
 
 
238 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  40.78 
 
 
272 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.67 
 
 
242 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.66 
 
 
218 aa  186  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  44.26 
 
 
249 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  43.57 
 
 
262 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  43.67 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  38.79 
 
 
240 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.57 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.05 
 
 
240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  43.38 
 
 
235 aa  163  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  40.6 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  41.06 
 
 
236 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.6 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  37.95 
 
 
243 aa  155  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  36.67 
 
 
238 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.58 
 
 
236 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  38.05 
 
 
227 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  39.81 
 
 
250 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  36.78 
 
 
238 aa  150  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  36.67 
 
 
238 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.87 
 
 
245 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  36.4 
 
 
235 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  34.87 
 
 
231 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.19 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  36.19 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  36.19 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  34.42 
 
 
250 aa  145  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  38.67 
 
 
244 aa  144  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.76 
 
 
235 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  37.71 
 
 
240 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  38.6 
 
 
264 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  36.73 
 
 
239 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  36.56 
 
 
240 aa  135  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  38.14 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  38.25 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.53 
 
 
235 aa  113  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  25.51 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  27.51 
 
 
487 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  28.19 
 
 
487 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  30.18 
 
 
465 aa  60.5  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  28.95 
 
 
475 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  30.26 
 
 
492 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  26.92 
 
 
491 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  25.39 
 
 
536 aa  55.5  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  30.46 
 
 
483 aa  55.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  25.12 
 
 
512 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  30.87 
 
 
506 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  25.12 
 
 
585 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  28.25 
 
 
492 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  28.57 
 
 
494 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  26.32 
 
 
488 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  25.13 
 
 
554 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  25.12 
 
 
531 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  25.12 
 
 
523 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  25.12 
 
 
535 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  25.12 
 
 
529 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  26.49 
 
 
484 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  24.7 
 
 
511 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  26.56 
 
 
507 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  24.7 
 
 
511 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  30.89 
 
 
505 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  27.05 
 
 
504 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  24.63 
 
 
545 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  28.83 
 
 
495 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  24.69 
 
 
500 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  27.74 
 
 
485 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  23.31 
 
 
501 aa  52.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  26.83 
 
 
511 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  27.21 
 
 
491 aa  52  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  28.18 
 
 
483 aa  52  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  29.3 
 
 
492 aa  52  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  26.04 
 
 
485 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>