124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13745 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  100 
 
 
231 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  84.28 
 
 
238 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  84.28 
 
 
238 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  83.84 
 
 
238 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  80.79 
 
 
238 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  79.48 
 
 
238 aa  357  9e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  71.86 
 
 
240 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  72.94 
 
 
245 aa  323  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  50.65 
 
 
235 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  50.89 
 
 
235 aa  201  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  50.85 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  48.26 
 
 
238 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  47.39 
 
 
236 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.39 
 
 
237 aa  181  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.85 
 
 
236 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  46.75 
 
 
250 aa  168  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  46.64 
 
 
247 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  43.72 
 
 
240 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.13 
 
 
243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  37.84 
 
 
243 aa  151  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  39.91 
 
 
245 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.83 
 
 
254 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  37.98 
 
 
241 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.87 
 
 
251 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.33 
 
 
238 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  41.77 
 
 
239 aa  148  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  40 
 
 
240 aa  147  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  40.36 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  33.93 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  33.93 
 
 
243 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  42.92 
 
 
240 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.58 
 
 
248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.27 
 
 
237 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  40.09 
 
 
250 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.79 
 
 
254 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.49 
 
 
248 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.99 
 
 
242 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.66 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.66 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.91 
 
 
248 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  40.53 
 
 
270 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.61 
 
 
243 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.44 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  40.38 
 
 
241 aa  135  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  35.53 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  39.83 
 
 
744 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  36.59 
 
 
250 aa  128  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.97 
 
 
255 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  34.76 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.93 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.82 
 
 
272 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  35.78 
 
 
243 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  35.78 
 
 
243 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  35.75 
 
 
270 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  35.96 
 
 
241 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  32.51 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  37.44 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  32 
 
 
261 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  30.36 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  30.62 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  30.53 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.64 
 
 
218 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  34.83 
 
 
262 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  29.3 
 
 
227 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  35.22 
 
 
772 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  35.22 
 
 
776 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  31.37 
 
 
501 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  31.12 
 
 
797 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  33.6 
 
 
512 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  35.54 
 
 
787 aa  54.3  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  32.33 
 
 
532 aa  53.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  31.01 
 
 
529 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  31.93 
 
 
534 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  33.9 
 
 
483 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  32.05 
 
 
512 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  34.58 
 
 
485 aa  49.7  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  32.05 
 
 
585 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  30.12 
 
 
483 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  32.05 
 
 
531 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  32.05 
 
 
523 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  32.05 
 
 
535 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  32.05 
 
 
529 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  31.33 
 
 
506 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  24.84 
 
 
465 aa  48.5  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  27.74 
 
 
494 aa  48.5  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  26.61 
 
 
507 aa  48.5  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  32.32 
 
 
511 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  32.32 
 
 
511 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  31.41 
 
 
545 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  33.61 
 
 
507 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  29.84 
 
 
475 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1060  pyridoxal 5'-phosphate synthase, glutaminase subunit Pdx2  32.99 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.149673 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  33.83 
 
 
517 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1072  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  27.41 
 
 
433 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  32.12 
 
 
501 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  30.4 
 
 
515 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  31.91 
 
 
480 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  30.26 
 
 
520 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  30.23 
 
 
514 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  31.84 
 
 
511 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.259752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>