157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0444 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  67.65 
 
 
243 aa  330  9e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  62.87 
 
 
241 aa  316  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  62.66 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  57.96 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  53.78 
 
 
243 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  53.11 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  55.42 
 
 
248 aa  248  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  54.43 
 
 
246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.03 
 
 
251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  53.06 
 
 
250 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  48.54 
 
 
243 aa  241  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  54.07 
 
 
270 aa  241  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  48.12 
 
 
243 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  59.09 
 
 
249 aa  238  8e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  48.1 
 
 
243 aa  235  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.44 
 
 
248 aa  234  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  48.15 
 
 
248 aa  232  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.69 
 
 
255 aa  230  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  53.45 
 
 
242 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.25 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.25 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  44.96 
 
 
241 aa  210  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.83 
 
 
237 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  46.59 
 
 
744 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  46.09 
 
 
272 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  45.34 
 
 
243 aa  205  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  45.34 
 
 
243 aa  205  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.92 
 
 
262 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.92 
 
 
238 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  46.27 
 
 
270 aa  199  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.7 
 
 
218 aa  187  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  41.7 
 
 
262 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  42.26 
 
 
240 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.74 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  41.45 
 
 
261 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  43.46 
 
 
235 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  44.2 
 
 
236 aa  168  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  43.16 
 
 
262 aa  166  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  36.82 
 
 
243 aa  162  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.51 
 
 
237 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  42.24 
 
 
235 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.94 
 
 
238 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  41.94 
 
 
238 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  41.38 
 
 
238 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  42.86 
 
 
240 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  41.01 
 
 
238 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  38.89 
 
 
227 aa  154  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  41.59 
 
 
250 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  39.13 
 
 
231 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  40.24 
 
 
264 aa  152  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.78 
 
 
235 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.73 
 
 
240 aa  151  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  40.29 
 
 
238 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.45 
 
 
236 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  43.56 
 
 
240 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.67 
 
 
245 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  39.81 
 
 
238 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  38.12 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  40.44 
 
 
239 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  38.77 
 
 
272 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  38.64 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.6 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.74 
 
 
235 aa  96.7  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  27.36 
 
 
492 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  27.36 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  23.98 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0043  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  27.5 
 
 
429 aa  58.9  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000316853  normal  0.33186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  35.06 
 
 
494 aa  58.5  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  28.38 
 
 
480 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  35.59 
 
 
484 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0462  cobyric acid synthase  28.3 
 
 
492 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0586994  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  29.49 
 
 
485 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  27.62 
 
 
495 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  28.02 
 
 
509 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  29.09 
 
 
465 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  32.32 
 
 
512 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  27 
 
 
534 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  32.24 
 
 
487 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  32.17 
 
 
502 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  28.81 
 
 
512 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  28.81 
 
 
531 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  28.81 
 
 
523 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  28.81 
 
 
529 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  28.81 
 
 
545 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  28.81 
 
 
535 aa  52  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  28.81 
 
 
585 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  28.48 
 
 
475 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  30.36 
 
 
485 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  27.19 
 
 
492 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  34.43 
 
 
492 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3068  cobyric acid synthase CobQ  29.63 
 
 
563 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0530  cobyric acid synthase  28.46 
 
 
491 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.479348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  29.73 
 
 
485 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0061  cobyric acid synthase CobQ  28.36 
 
 
954 aa  49.7  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  32 
 
 
495 aa  49.7  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  28.74 
 
 
501 aa  49.3  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  22.82 
 
 
509 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  31.34 
 
 
503 aa  48.9  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
524 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>