144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1789 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  66.39 
 
 
244 aa  342  2.9999999999999997e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  51.85 
 
 
235 aa  265  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  55.61 
 
 
262 aa  256  3e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  54.71 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  50.44 
 
 
262 aa  235  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.96 
 
 
218 aa  216  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  44.78 
 
 
243 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  44.35 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.05 
 
 
248 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.05 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  40.25 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.65 
 
 
246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  38.6 
 
 
270 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  37.4 
 
 
243 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.76 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.32 
 
 
243 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  38.94 
 
 
245 aa  164  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.33 
 
 
238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.81 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.82 
 
 
243 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  36.49 
 
 
241 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  37.61 
 
 
227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.95 
 
 
251 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.29 
 
 
255 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  36.24 
 
 
241 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  35.75 
 
 
744 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  35.84 
 
 
240 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.93 
 
 
242 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.39 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  35.29 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  34.68 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  34.68 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  34.39 
 
 
241 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  35.4 
 
 
250 aa  132  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.25 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.25 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  35.68 
 
 
249 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.67 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.2 
 
 
262 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35 
 
 
237 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  36.25 
 
 
270 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  34.68 
 
 
264 aa  123  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  31.51 
 
 
238 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  30.36 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.26 
 
 
245 aa  109  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  30.34 
 
 
235 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  28.63 
 
 
238 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  28.87 
 
 
238 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  28.87 
 
 
238 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.63 
 
 
237 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  30.34 
 
 
236 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  27.75 
 
 
238 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  28.87 
 
 
238 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.39 
 
 
240 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.91 
 
 
236 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  31.85 
 
 
239 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.07 
 
 
235 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  31.25 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  27.69 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  31.2 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  29.66 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.02 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  33.33 
 
 
787 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1259  cobyric acid synthase  28.14 
 
 
509 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.326028  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  27.75 
 
 
491 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  27.05 
 
 
532 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  28.48 
 
 
494 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  27.75 
 
 
500 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  28.57 
 
 
495 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  26.82 
 
 
518 aa  52.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  26.9 
 
 
489 aa  52  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  25.78 
 
 
492 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  31.54 
 
 
511 aa  50.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  25.56 
 
 
509 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  29.93 
 
 
492 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  28.15 
 
 
491 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  27.22 
 
 
495 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  24.56 
 
 
485 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  27.22 
 
 
495 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  27.13 
 
 
797 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  29.93 
 
 
505 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  26.32 
 
 
495 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  31.15 
 
 
506 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  26.92 
 
 
516 aa  48.9  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  29.51 
 
 
490 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  30.33 
 
 
503 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  30.33 
 
 
503 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2612  cobyric acid synthase CobQ  24.73 
 
 
494 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  27.14 
 
 
495 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  27.91 
 
 
487 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  28.99 
 
 
527 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  27.69 
 
 
481 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1989  cobyric acid synthase  29.01 
 
 
482 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.56437  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  25 
 
 
484 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  29.93 
 
 
492 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  24.24 
 
 
477 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  30.83 
 
 
481 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  29.55 
 
 
493 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>