171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3449 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  94.69 
 
 		 240 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  61.86 
 
 		 239 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  60.76 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  59.92 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  55.98 
 
 		 236 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  56.41 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  54.7 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  52.94 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  46.78 
 
 		 235 aa  195  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  47.83 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  46.69 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.34 
 
 		 240 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  43.22 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.7 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  42.37 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  43.93 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.51 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  43.51 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  43.72 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.86 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.74 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.73 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  39.15 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.22 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.71 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.59 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  37.34 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  39.59 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  37.34 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.33 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.15 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  37.97 
 
 		 744 aa  133  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.24 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.24 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  35.53 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.84 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.53 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  37.92 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  36.36 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.98 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.21 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  38.84 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  37.35 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.55 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  34.58 
 
 		 240 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.47 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  35.48 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  35.48 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.1 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  33.96 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.95 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  32.11 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  33.47 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  30.64 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  36.15 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  31.65 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  31.45 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  33.33 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  30.96 
 
 		 262 aa  96.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  30.93 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  28.5 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  30.25 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  29.05 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  31.9 
 
 		 484 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  28.91 
 
 		 465 aa  55.5  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  31.72 
 
 		 545 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  32.8 
 
 		 512 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  31.72 
 
 		 585 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  30.73 
 
 		 520 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  32 
 
 		 494 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  31.72 
 
 		 531 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  31.72 
 
 		 523 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  31.72 
 
 		 535 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  31.72 
 
 		 529 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  33.54 
 
 		 516 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  31.52 
 
 		 488 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  27.61 
 
 		 492 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  28.33 
 
 		 501 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  33.53 
 
 		 480 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  28.18 
 
 		 536 aa  52  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  29.29 
 
 		 481 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  29.29 
 
 		 481 aa  52  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  31.03 
 
 		 526 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  27.61 
 
 		 492 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  33.53 
 
 		 480 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  27.33 
 
 		 488 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  27.65 
 
 		 556 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  27.65 
 
 		 565 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  30.54 
 
 		 485 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  31.36 
 
 		 486 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  31.4 
 
 		 503 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  30.72 
 
 		 488 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  31.74 
 
 		 489 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2756  cobyric acid synthase  32.22 
 
 		 485 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.476578  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  30.43 
 
 		 483 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  31.65 
 
 		 512 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3138  cobyric acid synthase  29.88 
 
 		 492 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.95176 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>