More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0858 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 465 aa  932    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  39.63 
 
 		 503 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  40.24 
 
 		 503 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  38.91 
 
 		 506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  36.73 
 
 		 518 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  37.67 
 
 		 787 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  39.24 
 
 		 772 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  38.87 
 
 		 776 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  38.05 
 
 		 797 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  39 
 
 		 494 aa  295  1e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  36.63 
 
 		 858 aa  294  2e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  35.03 
 
 		 863 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  35.37 
 
 		 863 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  37.5 
 
 		 864 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  36.16 
 
 		 483 aa  292  8e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  35.27 
 
 		 551 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  36.01 
 
 		 490 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  36.42 
 
 		 490 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  35.18 
 
 		 517 aa  290  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  36.35 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  36.31 
 
 		 514 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  35.74 
 
 		 506 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1119  cobyric acid synthase  37.68 
 
 		 487 aa  286  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155962  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  36.23 
 
 		 481 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1300  cobyric acid synthase  37.83 
 
 		 487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.203276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  36.74 
 
 		 777 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  37.4 
 
 		 514 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  35.95 
 
 		 513 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  36.69 
 
 		 483 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  36.22 
 
 		 507 aa  282  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  35.17 
 
 		 509 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  35.83 
 
 		 484 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  36.2 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  35.99 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  40.3 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  36.66 
 
 		 484 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2177  cobyric acid synthase CobQ  35.37 
 
 		 561 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  37.71 
 
 		 532 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  36.17 
 
 		 491 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  33.06 
 
 		 507 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  35.22 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  36.8 
 
 		 488 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  34.89 
 
 		 536 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  36.46 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  34.47 
 
 		 506 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  34.97 
 
 		 500 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  34.14 
 
 		 506 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  34.27 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  33.94 
 
 		 506 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  35.99 
 
 		 485 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  37.06 
 
 		 487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  35.29 
 
 		 852 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  35.06 
 
 		 480 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  34.58 
 
 		 496 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  34.27 
 
 		 506 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  35.38 
 
 		 495 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  34.63 
 
 		 509 aa  272  9e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  35.22 
 
 		 481 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  34.71 
 
 		 500 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1655  cobyric acid synthase CobQ  36.91 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1628  cobyric acid synthase CobQ  36.91 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  34.72 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  33.88 
 
 		 502 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  35.01 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.79 
 
 		 494 aa  270  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  34.7 
 
 		 483 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  35.33 
 
 		 496 aa  269  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  35.74 
 
 		 495 aa  269  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2161  cobyric acid synthase  33.09 
 
 		 539 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  34.58 
 
 		 500 aa  269  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  37.08 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  34.58 
 
 		 491 aa  268  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  35.52 
 
 		 484 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  31.06 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  35.7 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  36.67 
 
 		 475 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  34.94 
 
 		 495 aa  267  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  35.55 
 
 		 480 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  36.8 
 
 		 485 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  35.76 
 
 		 527 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  35.27 
 
 		 515 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  34.86 
 
 		 488 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  37.94 
 
 		 501 aa  266  7e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  33.82 
 
 		 483 aa  266  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2912  cobyric acid synthase  35.4 
 
 		 478 aa  266  8e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.698516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  36.84 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  35.61 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  33.98 
 
 		 541 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  36.97 
 
 		 477 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  34.41 
 
 		 489 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  34.07 
 
 		 534 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  35.2 
 
 		 494 aa  264  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  34.49 
 
 		 489 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  34.3 
 
 		 495 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  35.08 
 
 		 510 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  35.25 
 
 		 483 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  33.54 
 
 		 498 aa  262  8e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  35.45 
 
 		 492 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  33.4 
 
 		 541 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3191  cobyric acid synthase  37.98 
 
 		 485 aa  262  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.293071  hitchhiker  0.00488811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>