158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4003 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  74.79 
 
 		 240 aa  350  1e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  70.82 
 
 		 238 aa  341  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  70.82 
 
 		 238 aa  338  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  70.39 
 
 		 238 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  70.39 
 
 		 238 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  73.45 
 
 		 231 aa  337  9e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  69.53 
 
 		 238 aa  332  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  50 
 
 		 235 aa  225  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  46.47 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  46.12 
 
 		 238 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  46.96 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  45.73 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.3 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  45.69 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  42.67 
 
 		 250 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  45.25 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  42.37 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.97 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  39.29 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.44 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.59 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.96 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.26 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.57 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.22 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.2 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.05 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  37.12 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  33.94 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  34.82 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.19 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  36.07 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  38.74 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  37.05 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  37.05 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  38.33 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.84 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.68 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.77 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  37.76 
 
 		 744 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.11 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  33.48 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.11 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.64 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  33.03 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  36.32 
 
 		 241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.26 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.48 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  35.11 
 
 		 270 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  34.58 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  37.29 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  35.12 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  33.04 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  32.38 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  33.64 
 
 		 261 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  31.55 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  33.18 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  31.19 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  32.14 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  31.88 
 
 		 262 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  31.34 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  28.26 
 
 		 243 aa  109  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  28.7 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  36.22 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  33.96 
 
 		 772 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  27.84 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  33.96 
 
 		 776 aa  59.3  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  26.87 
 
 		 492 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  32.47 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  33.12 
 
 		 485 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  28.57 
 
 		 488 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  26.51 
 
 		 483 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  30.43 
 
 		 536 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  29.9 
 
 		 501 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  30.07 
 
 		 481 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  29.41 
 
 		 485 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  28.85 
 
 		 500 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  30 
 
 		 484 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  29.95 
 
 		 532 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  28.85 
 
 		 500 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  30.52 
 
 		 480 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  27.75 
 
 		 534 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  33.12 
 
 		 485 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  30.13 
 
 		 484 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  28.31 
 
 		 534 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  29.69 
 
 		 520 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  24.88 
 
 		 536 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  30.61 
 
 		 512 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  30.61 
 
 		 585 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  32.81 
 
 		 503 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  27.89 
 
 		 465 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0462  cobyric acid synthase  30.17 
 
 		 492 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0586994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1889  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.76 
 
 		 436 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.659609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  28.66 
 
 		 485 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  30.61 
 
 		 531 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  30.61 
 
 		 523 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  30.61 
 
 		 535 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  30.61 
 
 		 529 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  29.38 
 
 		 529 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>