75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0439 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  70.45 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  58.61 
 
 		 243 aa  277  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  58.2 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  52.24 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  49.8 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  50.6 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.37 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  47.56 
 
 		 245 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  51.02 
 
 		 243 aa  245  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  49.59 
 
 		 243 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  49.37 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.97 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  49.18 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  48.15 
 
 		 243 aa  232  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  47.76 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.97 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.56 
 
 		 264 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.56 
 
 		 264 aa  207  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.26 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  42.98 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.75 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  40.8 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.19 
 
 		 242 aa  191  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  42.35 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  47.09 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  44.64 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.44 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  44.98 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  41.63 
 
 		 270 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  40.16 
 
 		 744 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  43.1 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  43.1 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  41.05 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.46 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.89 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  41.06 
 
 		 244 aa  171  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  43.27 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  42.45 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  42.45 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  42.92 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  38.4 
 
 		 250 aa  162  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  42.6 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  36.49 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.1 
 
 		 237 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  37.44 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  37.44 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  38.1 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  37.62 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  36.49 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  37.26 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.65 
 
 		 240 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.53 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  35.55 
 
 		 238 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  34.45 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.05 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.48 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  39.53 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  38.6 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.82 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  31.82 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  34.7 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  33.77 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.86 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  31.09 
 
 		 532 aa  52.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  30.29 
 
 		 516 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4467  cobyric acid synthase  26 
 
 		 485 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.540538  normal  0.0758348 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  29.21 
 
 		 492 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  29.03 
 
 		 494 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2189  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.95 
 
 		 465 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  26.97 
 
 		 492 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.4 
 
 		 458 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  27.43 
 
 		 524 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  26.74 
 
 		 488 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  26.8 
 
 		 492 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>