118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1600 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  66.39 
 
 
243 aa  342  2.9999999999999997e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  54.04 
 
 
235 aa  261  6e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  52.92 
 
 
262 aa  248  7e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  53.57 
 
 
261 aa  247  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  50.88 
 
 
262 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.75 
 
 
218 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  45.02 
 
 
243 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  44.59 
 
 
243 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.06 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  39.75 
 
 
250 aa  168  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.59 
 
 
238 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  37.6 
 
 
243 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40 
 
 
248 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.78 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  41.56 
 
 
227 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  38.82 
 
 
245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  38.33 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.23 
 
 
254 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.6 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  37.9 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.98 
 
 
248 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.12 
 
 
243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  34.17 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.67 
 
 
251 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.61 
 
 
242 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.23 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  34.73 
 
 
744 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.08 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  36.57 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 
240 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  37 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  34.53 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  34.53 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.44 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.44 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  34.22 
 
 
250 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  33.78 
 
 
241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  37.95 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.45 
 
 
237 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  37.71 
 
 
270 aa  125  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.61 
 
 
262 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  37.66 
 
 
272 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  34.58 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.89 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  31.82 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.17 
 
 
237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.87 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  32.39 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  30.53 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.25 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  32.42 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  29.71 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  29.29 
 
 
238 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  29.29 
 
 
238 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  28.7 
 
 
238 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  28.07 
 
 
238 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  30.2 
 
 
272 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  30.08 
 
 
235 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  31.45 
 
 
240 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  31.47 
 
 
240 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  26.29 
 
 
235 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  30.45 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  31.78 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  31.62 
 
 
505 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  26.99 
 
 
534 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  29.32 
 
 
514 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  28.91 
 
 
511 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  30.19 
 
 
494 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  29.49 
 
 
480 aa  48.9  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  22.99 
 
 
498 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  25.95 
 
 
516 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  23.87 
 
 
502 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  28.69 
 
 
787 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  27.42 
 
 
484 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  22.8 
 
 
511 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  28.1 
 
 
495 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  25.58 
 
 
520 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13521  cobyric acid synthase  27.71 
 
 
509 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  26.58 
 
 
488 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  31.58 
 
 
492 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  23.6 
 
 
488 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13371  cobyric acid synthase  30.36 
 
 
495 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.405495  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  26.72 
 
 
491 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  25.28 
 
 
485 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  21.51 
 
 
525 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  23.94 
 
 
483 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  29.37 
 
 
496 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  23.62 
 
 
480 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  22.28 
 
 
481 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  22.62 
 
 
483 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13271  cobyric acid synthase  29.6 
 
 
510 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  25.76 
 
 
535 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  22.62 
 
 
506 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  24.72 
 
 
475 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  31.34 
 
 
492 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  22.97 
 
 
485 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  25.76 
 
 
512 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  25.76 
 
 
585 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  27.1 
 
 
465 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>