112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0883 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  100 
 
 
261 aa  534  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  81.99 
 
 
262 aa  448  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  60.54 
 
 
262 aa  317  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  55.56 
 
 
235 aa  262  4.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  54.71 
 
 
243 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  53.57 
 
 
244 aa  247  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  52.34 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  51.13 
 
 
243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  52.29 
 
 
218 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  45.32 
 
 
246 aa  182  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.1 
 
 
248 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  44.13 
 
 
227 aa  180  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  43.95 
 
 
243 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.98 
 
 
238 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.79 
 
 
254 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  38 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.08 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.45 
 
 
243 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.08 
 
 
248 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  39.06 
 
 
245 aa  169  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.57 
 
 
242 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  39.48 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  40.43 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.6 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.65 
 
 
243 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.91 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  40.28 
 
 
241 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  40.2 
 
 
243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  37.85 
 
 
243 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  37.85 
 
 
243 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  40.25 
 
 
249 aa  141  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  39.15 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.8 
 
 
272 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  33.19 
 
 
744 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.87 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  37.96 
 
 
250 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.5 
 
 
264 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.5 
 
 
264 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  36.12 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  36.73 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.36 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  35.32 
 
 
240 aa  132  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.48 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.78 
 
 
262 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  33.65 
 
 
235 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  32.77 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.64 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  31.73 
 
 
238 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  31.58 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  31.6 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.2 
 
 
237 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  32 
 
 
231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  34.58 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.04 
 
 
236 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  30.62 
 
 
238 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  30.62 
 
 
238 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  30.77 
 
 
238 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  31.65 
 
 
240 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  31.65 
 
 
240 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  30.99 
 
 
250 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  28.07 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  28.64 
 
 
235 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  30.66 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.54 
 
 
235 aa  84  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  32 
 
 
511 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  31.4 
 
 
465 aa  55.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  32.39 
 
 
492 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  32.39 
 
 
492 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  25.93 
 
 
787 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  29.21 
 
 
534 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  25.41 
 
 
488 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  28.21 
 
 
483 aa  48.9  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  30.25 
 
 
506 aa  48.9  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  30.23 
 
 
505 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2918  cobyric acid synthase  25.62 
 
 
525 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.182709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  27.73 
 
 
490 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  31.5 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3549  cobyric acid synthase  27.64 
 
 
516 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  27.27 
 
 
493 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  25.62 
 
 
477 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  27.27 
 
 
492 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  27.64 
 
 
484 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  29.91 
 
 
489 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  24.31 
 
 
484 aa  46.6  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  29.6 
 
 
502 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  26.83 
 
 
485 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  28.93 
 
 
481 aa  45.8  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  29.14 
 
 
534 aa  46.2  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  28 
 
 
514 aa  45.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  29.75 
 
 
507 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  25.32 
 
 
512 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3138  cobyric acid synthase  24.43 
 
 
492 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.95176 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  22.58 
 
 
501 aa  45.4  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  24.79 
 
 
489 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  29.71 
 
 
494 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1012  cobyric acid synthase  29.37 
 
 
506 aa  43.9  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0333  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.21 
 
 
444 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  27.6 
 
 
536 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  30.77 
 
 
491 aa  44.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  25.62 
 
 
525 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>