123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1207 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  63.74 
 
 		 262 aa  334  7e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  60.54 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  50.44 
 
 		 243 aa  235  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  50.88 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  50.93 
 
 		 235 aa  230  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  51.65 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  51.24 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  47.69 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.97 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.1 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  43.03 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.57 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  39.67 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  44.1 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  43.19 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.16 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  41.56 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.8 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  39.18 
 
 		 245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.24 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.96 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  41.94 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  41.94 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.27 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  41.47 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  38.74 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  40.85 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.78 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  37.34 
 
 		 744 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  38.64 
 
 		 264 aa  139  7e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.06 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  38.93 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  37.79 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.72 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  36.96 
 
 		 270 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.59 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  38.43 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.14 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.14 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  37.05 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.51 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.89 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.04 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  33.97 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  32.86 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  32.86 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  33.02 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  33.97 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  35.37 
 
 		 236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.92 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.29 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  33.04 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  34.2 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  34.83 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  32.54 
 
 		 235 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  31.36 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  31.51 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  30.96 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  32.19 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.76 
 
 		 235 aa  89  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.3 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  31.92 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  24.28 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2361  cobyric acid synthase  31.36 
 
 		 495 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  30.77 
 
 		 494 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  30.47 
 
 		 481 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  29.1 
 
 		 536 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  28.57 
 
 		 485 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1991  cobyric acid synthase  29.87 
 
 		 487 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  26.7 
 
 		 491 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  28.87 
 
 		 491 aa  48.9  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  33.96 
 
 		 465 aa  48.9  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  29.23 
 
 		 787 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  31.85 
 
 		 514 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  25.53 
 
 		 527 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  29.77 
 
 		 491 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  26.04 
 
 		 492 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  26.78 
 
 		 495 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  28.18 
 
 		 484 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  26.26 
 
 		 509 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  30.38 
 
 		 505 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  29.08 
 
 		 496 aa  46.2  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  27.22 
 
 		 481 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  27.23 
 
 		 498 aa  45.8  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  28.8 
 
 		 534 aa  45.8  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  26.85 
 
 		 493 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  28.07 
 
 		 484 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  29.57 
 
 		 490 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  24.76 
 
 		 486 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1734  cobyric acid synthase CobQ  27.81 
 
 		 498 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.534175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  25.32 
 
 		 480 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  29.17 
 
 		 518 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  31.82 
 
 		 864 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  27.08 
 
 		 510 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.48 
 
 		 441 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0766234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  30.6 
 
 		 575 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.01 
 
 		 445 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.445117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  25.56 
 
 		 500 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>