More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4598 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4598  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1280 aa  2506    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.744008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3285  DNA polymerase III, alpha subunit  40.62 
 
 		 1268 aa  753    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.293233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2044  DNA polymerase III, alpha subunit  44.74 
 
 		 1161 aa  930    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000242866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3215  DNA polymerase III, alpha subunit  41.77 
 
 		 1320 aa  767    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.235768  decreased coverage  0.00141358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2318  DNA polymerase III, alpha subunit  45.6 
 
 		 1166 aa  847    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00938531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10660  DNA-directed DNA polymerase III PolC  48.63 
 
 		 1232 aa  489  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000722079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2570  DNA polymerase III subunit alpha  40.88 
 
 		 1155 aa  393  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256631  normal  0.63829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4325  DNA polymerase III, alpha subunit  43.5 
 
 		 1152 aa  386  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628053  normal  0.717178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  28.05 
 
 		 1225 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  27.66 
 
 		 1145 aa  350  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  26.96 
 
 		 1134 aa  345  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16040  DNA polymerase III, alpha subunit  40.92 
 
 		 1260 aa  342  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.390717  normal  0.0575947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  27.98 
 
 		 1184 aa  342  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3229  DNA polymerase III, alpha subunit  27.85 
 
 		 1195 aa  332  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909958  normal  0.738512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0272  DNA polymerase III subunit alpha  26.02 
 
 		 1160 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218941  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  26.02 
 
 		 1160 aa  312  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.783595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0269  DNA polymerase III subunit alpha  25.93 
 
 		 1160 aa  311  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.814092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0253  DNA polymerase III subunit alpha  25.93 
 
 		 1160 aa  310  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.791308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3419  DNA polymerase III, alpha subunit  25.74 
 
 		 1160 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0188  DNA polymerase III subunit alpha  25.74 
 
 		 1160 aa  310  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0293384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0257  DNA polymerase III subunit alpha  25.93 
 
 		 1160 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.988974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0195  DNA polymerase III subunit alpha  25.65 
 
 		 1160 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0194  DNA polymerase III subunit alpha  25.83 
 
 		 1160 aa  309  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00182  DNA polymerase III subunit alpha  25.83 
 
 		 1160 aa  309  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00181  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1160 aa  309  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.466902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0186  DNA polymerase III subunit alpha  25.83 
 
 		 1160 aa  309  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0596563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3476  DNA polymerase III subunit alpha  25.83 
 
 		 1160 aa  308  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0843038  normal  0.113533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1154  DNA polymerase III subunit alpha  25.6 
 
 		 1157 aa  307  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1849  DNA polymerase III, alpha subunit  27.51 
 
 		 1182 aa  307  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2786  DNA polymerase III subunit alpha  24.98 
 
 		 1149 aa  305  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0198  DNA polymerase III, alpha subunit  26.3 
 
 		 1272 aa  305  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0979698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0177  DNA polymerase III subunit alpha  25.74 
 
 		 1160 aa  304  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  28.63 
 
 		 1068 aa  303  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  28.56 
 
 		 1031 aa  302  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.86 
 
 		 1157 aa  302  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0583  DNA polymerase III, alpha subunit  26.02 
 
 		 1168 aa  301  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  29.69 
 
 		 1072 aa  301  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1480  DNA polymerase III, alpha subunit  26.12 
 
 		 1159 aa  301  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.563322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  28.82 
 
 		 1047 aa  300  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0335  DNA polymerase III DnaE  24.88 
 
 		 1186 aa  300  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  29.69 
 
 		 1063 aa  300  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  31.84 
 
 		 1044 aa  300  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  29.69 
 
 		 1072 aa  300  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4061  DNA polymerase III, alpha subunit  26.38 
 
 		 1174 aa  300  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496247  normal  0.0397833 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  29.69 
 
 		 1072 aa  300  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  29.69 
 
 		 1063 aa  300  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  29.69 
 
 		 1063 aa  300  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  32.97 
 
 		 1031 aa  300  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  29.69 
 
 		 1063 aa  300  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0831  DNA polymerase III, alpha subunit  27.07 
 
 		 1132 aa  299  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3346  DNA polymerase III subunit alpha  28.13 
 
 		 1142 aa  298  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1570  DNA polymerase III subunit alpha  25.51 
 
 		 1186 aa  298  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.749203  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  28.69 
 
 		 1071 aa  297  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  28.69 
 
 		 1071 aa  297  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2731  DNA polymerase III, alpha subunit  26.97 
 
 		 1174 aa  295  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0445  error-prone DNA polymerase  33.61 
 
 		 1084 aa  295  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1532  DNA polymerase III, alpha subunit  29.49 
 
 		 1099 aa  295  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0291245  normal  0.633763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2693  DNA polymerase III subunit alpha  24.91 
 
 		 1158 aa  295  5e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112631 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  28.51 
 
 		 1071 aa  294  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1363  DNA polymerase III subunit alpha  25.4 
 
 		 1157 aa  294  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  29.64 
 
 		 1076 aa  294  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1028  DNA polymerase III subunit alpha  24.55 
 
 		 1160 aa  293  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0916  DNA polymerase III subunit alpha  24.51 
 
 		 1162 aa  292  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0578  DNA polymerase III subunit alpha  25.38 
 
 		 1168 aa  293  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  28.47 
 
 		 1071 aa  293  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3420  DNA polymerase III subunit alpha  24.55 
 
 		 1171 aa  292  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1644  DNA polymerase III subunit alpha  24.95 
 
 		 1158 aa  292  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  28.88 
 
 		 1071 aa  292  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0956  DNA polymerase III subunit alpha  24.7 
 
 		 1160 aa  292  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.582605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2800  DNA polymerase III subunit alpha  25.02 
 
 		 1158 aa  291  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.867982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1286  DNA polymerase III, alpha subunit  26.4 
 
 		 1165 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  28.44 
 
 		 1071 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  24.79 
 
 		 1156 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3345  DNA polymerase III subunit alpha  24.6 
 
 		 1160 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2412  DNA polymerase III subunit alpha  24.93 
 
 		 1159 aa  291  6e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2626  DNA polymerase III subunit alpha  24.81 
 
 		 1158 aa  290  8e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0206088 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  29.33 
 
 		 1109 aa  290  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1460  DNA polymerase III subunit alpha  25.21 
 
 		 1157 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1081  DNA polymerase III subunit alpha  24.46 
 
 		 1171 aa  290  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.990862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3146  DNA polymerase III subunit alpha  25.56 
 
 		 1157 aa  290  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156717 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1496  DNA polymerase III subunit alpha  25.12 
 
 		 1157 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.86585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3038  DNA polymerase III subunit alpha  26.76 
 
 		 1176 aa  289  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  32.23 
 
 		 1024 aa  288  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2887  DNA polymerase III subunit alpha  25.12 
 
 		 1157 aa  288  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0886013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0722  DNA polymerase III subunit alpha  25.32 
 
 		 1160 aa  288  5e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.809003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2620  DNA polymerase III subunit alpha  25.26 
 
 		 1157 aa  288  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  25.26 
 
 		 1155 aa  288  7e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1913  DNA polymerase III subunit alpha  27.3 
 
 		 1174 aa  287  7e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00377925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0824  DNA polymerase III subunit alpha  27.3 
 
 		 1174 aa  287  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0327  DNA polymerase III subunit alpha  27.3 
 
 		 1174 aa  287  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  28.28 
 
 		 1031 aa  287  8e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002762  DNA polymerase III alpha subunit  25.12 
 
 		 1159 aa  287  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1044  DNA polymerase III, alpha subunit, form 1  26.76 
 
 		 1686 aa  287  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.108134  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  27.28 
 
 		 1087 aa  287  9e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1197  DNA polymerase III subunit alpha  27.4 
 
 		 1274 aa  287  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  25.44 
 
 		 1155 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1285  DNA polymerase III subunit alpha  25.15 
 
 		 1158 aa  287  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.876044  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2965  DNA polymerase III subunit alpha  25.14 
 
 		 1160 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3150  DNA polymerase III subunit alpha  25.43 
 
 		 1160 aa  286  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00762737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1206  DNA polymerase III subunit alpha  27.4 
 
 		 1174 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>