149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2335 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2335  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  100 
 
 		 152 aa  304  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1591  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  71.43 
 
 		 151 aa  210  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2945  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  70.42 
 
 		 151 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1124  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  66.45 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  69.29 
 
 		 151 aa  205  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0593927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1758  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  70.86 
 
 		 160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3974  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  63.57 
 
 		 147 aa  173  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1192  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.95 
 
 		 162 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.164675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1438  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.55 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2131  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.59 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3072  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.9 
 
 		 170 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1407  CcmE/CycJ protein  45.89 
 
 		 177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  0.044054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1402  CcmE/CycJ protein  45.21 
 
 		 169 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0579765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1682  CcmE/CycJ protein  45.89 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4167  CcmE/CycJ protein  46.38 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.97506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0437  CcmE/CycJ protein  45.99 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.898696 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1956  CcmE/CycJ protein  49.63 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3411  CcmE/CycJ protein  45.52 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0634  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.36 
 
 		 150 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4432  CcmE/CycJ protein  45.07 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1210  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.01 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0940  CcmE/CycJ protein  48.91 
 
 		 160 aa  123  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2231  CcmE/CycJ protein  46.58 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1368  CcmE/CycJ protein  44.44 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4992  CcmE/CycJ protein  43.66 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4000  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  50.79 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1656  CcmE/CycJ protein  45.77 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0590043  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2851  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.67 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2445  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.93 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2002  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.14 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0854915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0036  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.66 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2389  CcmE/CycJ protein  42.86 
 
 		 148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000465809  hitchhiker  0.0000169604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.91 
 
 		 165 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0459521  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3449  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.76 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1514  CcmE/CycJ protein  46.32 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4769  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.52 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1070  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.94 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1581  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.95 
 
 		 151 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409535  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.17 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.534215  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0921  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.97 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244094  normal  0.0612826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1517  CcmE/CycJ protein  45.8 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2957  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.68 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2853  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.78 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1379  CcmE/CycJ protein  50.88 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3649  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.92 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1363  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.1 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2933  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.13 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.601085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0041  CcmE/CycJ protein  50.44 
 
 		 147 aa  110  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3995  CcmE/CycJ protein  49.14 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1548  CcmE/CycJ protein  41.67 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.89 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.61 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0898  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.15 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1686  CcmE/CycJ protein  49.19 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45330  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.18 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4323  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.76 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1544  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.76 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3848  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.18 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1212  CcmE/CycJ protein  42.75 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2787  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.42 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3892  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.07 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3989  CcmE/CycJ protein  39.19 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.57 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.46 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2109  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.53 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3631  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.17 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4057  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  50.91 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06066  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.6 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0237058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00861  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.6 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30410  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.61 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3020  CcmE/CycJ protein  40.43 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.35 
 
 		 143 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.73 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03070  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.22 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.884076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.73 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.377712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1500  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.73 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2670  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.23 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.35 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0286  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.19 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0843854  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0373  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.33 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0940  CcmE/CycJ protein  38.06 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1641  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.09 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02124  periplasmic heme chaperone  36.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1462  CcmE/CycJ protein  36.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1825  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  32.64 
 
 		 166 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.153118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1870  cysteinyl-tRNA synthetase, class Ia  38.85 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0397  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.84 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.322278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02083  hypothetical protein  36.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0607  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.41 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3334  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2335  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2496  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0744  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1453  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.77 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2345  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.77 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.666596 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00217  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.32 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2385  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0586  CcmE/CycJ protein  46.36 
 
 		 149 aa  97.1  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2490  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.81 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>