145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2853 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2853  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  100 
 
 
173 aa  354  2.9999999999999997e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2933  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  50.94 
 
 
173 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.601085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1192  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.72 
 
 
162 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.164675  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1438  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.5 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2131  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.33 
 
 
167 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4432  CcmE/CycJ protein  44.91 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1656  CcmE/CycJ protein  45.12 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0590043  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3072  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.16 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1407  CcmE/CycJ protein  47.26 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  0.044054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1402  CcmE/CycJ protein  46.58 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0579765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1682  CcmE/CycJ protein  44.38 
 
 
173 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125313  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4167  CcmE/CycJ protein  46.58 
 
 
168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.97506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1363  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.26 
 
 
149 aa  124  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0940  CcmE/CycJ protein  43.4 
 
 
160 aa  124  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1835  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.45 
 
 
165 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0459521  normal  0.708765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4992  CcmE/CycJ protein  45.58 
 
 
170 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000144292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2445  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.59 
 
 
156 aa  121  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2851  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.27 
 
 
156 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846443  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0634  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.83 
 
 
150 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361156  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0036  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.21 
 
 
153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2231  CcmE/CycJ protein  41.78 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0437  CcmE/CycJ protein  41.22 
 
 
166 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.898696 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0940  CcmE/CycJ protein  43.21 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1368  CcmE/CycJ protein  38.67 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0921  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.95 
 
 
171 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244094  normal  0.0612826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2335  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.78 
 
 
152 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3449  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.04 
 
 
165 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4057  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  49.22 
 
 
149 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30033  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1070  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.95 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4769  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.3 
 
 
159 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1758  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.31 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3974  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.75 
 
 
147 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1591  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.97 
 
 
151 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2945  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.67 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.28 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0593927 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40 
 
 
153 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2002  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.36 
 
 
164 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0854915  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1124  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.86 
 
 
147 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1210  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.45 
 
 
148 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0898  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.61 
 
 
144 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137616  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1212  CcmE/CycJ protein  44.67 
 
 
154 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2787  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.56 
 
 
161 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1956  CcmE/CycJ protein  39.31 
 
 
159 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.78 
 
 
165 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1548  CcmE/CycJ protein  40.85 
 
 
153 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45330  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.62 
 
 
162 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0607  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.78 
 
 
165 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2670  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.1 
 
 
165 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2389  CcmE/CycJ protein  41.1 
 
 
148 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000465809  hitchhiker  0.0000169604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3848  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.06 
 
 
162 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02124  periplasmic heme chaperone  38.51 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1462  CcmE/CycJ protein  38.51 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2957  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.55 
 
 
151 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02083  hypothetical protein  38.51 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0373  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.54 
 
 
162 aa  100  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3334  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.51 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0744  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.51 
 
 
159 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251219  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.16 
 
 
164 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2335  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.51 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2496  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.51 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.16 
 
 
164 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.377712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1500  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.16 
 
 
164 aa  100  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1453  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.51 
 
 
159 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1514  CcmE/CycJ protein  40.69 
 
 
144 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.76 
 
 
164 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1581  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.11 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409535  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2345  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  37.84 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.666596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30410  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.57 
 
 
155 aa  98.6  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2385  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.91 
 
 
159 aa  98.2  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3411  CcmE/CycJ protein  36.17 
 
 
155 aa  97.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4147  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.91 
 
 
159 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2490  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.91 
 
 
159 aa  97.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.76 
 
 
155 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0041  CcmE/CycJ protein  43.7 
 
 
147 aa  97.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3892  CcmE/CycJ protein  42.76 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0109429  normal  0.592232 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4026  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.42 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0431  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.43 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2476  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.42 
 
 
159 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0523388  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4098  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.57 
 
 
159 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2434  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.57 
 
 
159 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.614283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3649  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.25 
 
 
151 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4205  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.18 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2593  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.18 
 
 
166 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.257893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1686  CcmE/CycJ protein  40.79 
 
 
158 aa  94.7  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.91 
 
 
143 aa  94.4  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1379  CcmE/CycJ protein  42.15 
 
 
144 aa  94  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4000  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.31 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0922  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.18 
 
 
143 aa  92.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4043  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.57 
 
 
159 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0397  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.87 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.322278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1641  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  33.78 
 
 
160 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2277  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  33.11 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03131  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  34.44 
 
 
161 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00217  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.43 
 
 
156 aa  87.8  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002845  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE heme chaperone  33.77 
 
 
161 aa  88.2  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03070  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  32.69 
 
 
164 aa  87.8  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.884076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3631  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  35.42 
 
 
157 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3020  CcmE/CycJ protein  36.49 
 
 
155 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0944  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.88 
 
 
147 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2109  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  33.12 
 
 
166 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>