157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1517 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1517  CcmE/CycJ protein  100 
 
 		 145 aa  288  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3989  CcmE/CycJ protein  61.87 
 
 		 155 aa  175  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  56.64 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.534215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1210  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.27 
 
 		 148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.260139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3389  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  50.39 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3649  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.18 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3848  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.15 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1581  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.15 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409535  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2851  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.33 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2445  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  47.33 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.816546 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2787  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.06 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1514  CcmE/CycJ protein  46.56 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45330  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  46.67 
 
 		 162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1956  CcmE/CycJ protein  48.09 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1368  CcmE/CycJ protein  40.28 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0419  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.6 
 
 		 153 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3995  CcmE/CycJ protein  48.85 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.60024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4323  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  53.21 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.117081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1544  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  53.21 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2957  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.93 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1379  CcmE/CycJ protein  49.62 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3892  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  49.18 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00332618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3631  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.85 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4769  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.04 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0586  CcmE/CycJ protein  48.09 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1212  CcmE/CycJ protein  47.01 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4000  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.04 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2389  CcmE/CycJ protein  41.98 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000465809  hitchhiker  0.0000169604 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3411  CcmE/CycJ protein  42.96 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1656  CcmE/CycJ protein  44.83 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0590043  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1438  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.75 
 
 		 162 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2335  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.8 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.689717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0899  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.41 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0593927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0036  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.34 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4057  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.15 
 
 		 149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.30033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0041  CcmE/CycJ protein  41.22 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0898  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.2 
 
 		 144 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137616  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1192  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.03 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.164675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00217  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.45 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0437  CcmE/CycJ protein  44.2 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.898696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1548  CcmE/CycJ protein  40.71 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2109  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.93 
 
 		 166 aa  111  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2945  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.64 
 
 		 151 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639036  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1591  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.64 
 
 		 151 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.86 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0373  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  45.87 
 
 		 162 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3573  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.75 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.075405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3072  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.48 
 
 		 170 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4167  CcmE/CycJ protein  46.56 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.97506  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1825  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.75 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.153118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1124  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.14 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1402  CcmE/CycJ protein  42.07 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0579765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1682  CcmE/CycJ protein  42.07 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.125313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2420  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.19 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2131  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.07 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1758  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  44.55 
 
 		 160 aa  103  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3731  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.03 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0433902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1407  CcmE/CycJ protein  41.38 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  0.044054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0241  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.66 
 
 		 162 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0554704  hitchhiker  0.000102983 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.61 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0391  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.61 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.377712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1500  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.61 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1686  CcmE/CycJ protein  41.79 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4028  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.03 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.781991  hitchhiker  0.0000000663113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1363  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.45 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3974  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  52.48 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0224  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.03 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.2014  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2933  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.65 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.601085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3387  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.28 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0227  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.03 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141464  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_002978  WD0972  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.36 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.411706  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30410  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  48.09 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0940  CcmE/CycJ protein  38.69 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0227  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.58 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0228693  unclonable  0.0000000000264125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0222  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.58 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0224  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  42.03 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0296266  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0286  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0843854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2724  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  39.19 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0259  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.58 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2231  CcmE/CycJ protein  39.86 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2670  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.55 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0608  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.85 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2593  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.93 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.257893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3252  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  36.91 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0175  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.3 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.268493  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0227  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.58 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153064  unclonable  0.0000000000366599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4205  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  38.93 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1564  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  41.67 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.114776  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0607  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.85 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03070  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.14 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.884076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02124  periplasmic heme chaperone  40 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1462  CcmE/CycJ protein  40 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0891  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  43.69 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2385  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40 
 
 		 159 aa  98.6  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0940  CcmE/CycJ protein  42.22 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0744  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2496  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0211  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40.58 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0270358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1453  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2345  cytochrome c-type biogenesis protein CcmE  40 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.666596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>