More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0729 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0729  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.570486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4464  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  28.3 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  28.84 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6292  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  25.8 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0148  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0716986  decreased coverage  0.0000000188935 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 304 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  24.75 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  26.69 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  26.02 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.72 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4831  LysR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496731  normal  0.988121 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  24.07 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 338 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2398  putative Rubisco transcriptional regulator  25.94 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5165  LysR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0295  putative Rubisco transcriptional regulator  26.22 
 
 		 331 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  27.76 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01621  putative Rubisco transcriptional regulator  24.72 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1039  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.204243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  24.67 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  25.19 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 297 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  23.73 
 
 		 314 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 327 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04720  Transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  28.57 
 
 		 305 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0371  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0342  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 336 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0401  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  25.09 
 
 		 300 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0397  LysR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 307 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  27.12 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 300 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0629  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0146  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 337 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  25.19 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  24.33 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2494  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  29.88 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  22.71 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06880  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0196299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  23.53 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  23.95 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.74 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1749  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  25.09 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4408  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.830984  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  24.47 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>