More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1239 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1239  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
303 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0864  ABC transporter, permease protein  98.35 
 
 
303 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.586541  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0794  ABC transporter, permease protein  98.02 
 
 
303 aa  573  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.485222  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0643  ABC transporter, permease protein  68.69 
 
 
221 aa  256  3e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.766537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  60.55 
 
 
224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  59.17 
 
 
224 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  46.43 
 
 
226 aa  206  6e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  55.94 
 
 
213 aa  203  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
224 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.96 
 
 
225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
225 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.22 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.06 
 
 
224 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.1 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 
217 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  55.12 
 
 
223 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
236 aa  175  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 
223 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  46.98 
 
 
225 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.68 
 
 
222 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
215 aa  172  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  46.51 
 
 
225 aa  172  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.76 
 
 
218 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  44.76 
 
 
218 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  46.76 
 
 
225 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  46.51 
 
 
225 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.88 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
221 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
224 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
222 aa  166  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.36 
 
 
225 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.45 
 
 
222 aa  163  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 
230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.36 
 
 
217 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
228 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
221 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.47 
 
 
223 aa  161  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  43.43 
 
 
224 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
222 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 
221 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
221 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  47.9 
 
 
217 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  44.98 
 
 
222 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  44.98 
 
 
222 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  44.98 
 
 
222 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.39 
 
 
222 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  42.47 
 
 
224 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
224 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.42 
 
 
221 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.19 
 
 
217 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.86 
 
 
226 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  44.02 
 
 
222 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
217 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
217 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
221 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 
217 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
217 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
219 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  46.71 
 
 
217 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 
217 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
221 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  41.9 
 
 
218 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 
217 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
222 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.9 
 
 
217 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.31 
 
 
217 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  40.78 
 
 
217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  41.45 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  41.45 
 
 
223 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
222 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
222 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 
217 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 
217 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 
217 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 
217 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 
217 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 
217 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.31 
 
 
217 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  47.31 
 
 
217 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  46.53 
 
 
213 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
218 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
222 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  49.21 
 
 
228 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
235 aa  152  8e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  37.34 
 
 
235 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  43.81 
 
 
228 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
217 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  44.02 
 
 
222 aa  150  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
246 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
223 aa  149  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  51.15 
 
 
219 aa  149  6e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.27 
 
 
223 aa  148  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0459046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  37.07 
 
 
231 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
227 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>