More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3885 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.02 
 
 
227 aa  390  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.02 
 
 
227 aa  390  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.58 
 
 
227 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 
235 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.22 
 
 
205 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
242 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536263  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 
225 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  47 
 
 
225 aa  174  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.51 
 
 
217 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  45.79 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  46.12 
 
 
225 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.05 
 
 
217 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  45.12 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  47.18 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.18 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  46.46 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
217 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  40.48 
 
 
226 aa  161  7e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  46.51 
 
 
224 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.86 
 
 
225 aa  160  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.51 
 
 
224 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  46.05 
 
 
224 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  46.81 
 
 
228 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  46.48 
 
 
223 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 
223 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.34 
 
 
246 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  46.48 
 
 
223 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
224 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  44.5 
 
 
218 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 
218 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.5 
 
 
213 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
215 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  45.21 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  45.21 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  45.21 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  45.21 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  45.21 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  45.21 
 
 
218 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
223 aa  151  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.44 
 
 
225 aa  151  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.38 
 
 
214 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 
218 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  44.33 
 
 
217 aa  151  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
223 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
217 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 
221 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  44.76 
 
 
217 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
228 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
227 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
223 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45 
 
 
224 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.06 
 
 
221 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  48.74 
 
 
217 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.71 
 
 
218 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.71 
 
 
218 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
230 aa  147  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  41.9 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  43.33 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  41.9 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  43.33 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0459046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1907  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  49.3 
 
 
218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1797  hypothetical protein  48.08 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2337  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.95 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790204  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0696244  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  43.18 
 
 
224 aa  146  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.45 
 
 
223 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
217 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1798  hypothetical protein  47.6 
 
 
215 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
222 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
221 aa  143  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
221 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
221 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
213 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
221 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
221 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
219 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
217 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  43.33 
 
 
216 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
214 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  41.67 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
214 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  44 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  40.87 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.79 
 
 
217 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
224 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3249  hypothetical protein  47.91 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>