More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2018 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 224 aa  430  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  71.75 
 
 		 225 aa  304  8.000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  66.82 
 
 		 226 aa  300  9e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.92 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  50 
 
 		 225 aa  197  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  50 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.64 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  53.66 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.73 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.33 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.27 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.27 
 
 		 221 aa  191  9e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.94 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  50 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  52.97 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  47.14 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.55 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  50.95 
 
 		 224 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.45 
 
 		 221 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  46.79 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  46.79 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  50.48 
 
 		 224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 		 224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.45 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  46.33 
 
 		 222 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.54 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.57 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  46.58 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.33 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.1 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  49.05 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.05 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  49.05 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 		 222 aa  177  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  46.58 
 
 		 224 aa  177  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  50.48 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  50.48 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.06 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  54.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.68 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  54.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  54.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  54.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  54.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  54.55 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  52.61 
 
 		 217 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  50.51 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.51 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 		 228 aa  174  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.71 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.71 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  51.72 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  45.87 
 
 		 222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  50.23 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.69 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  47.32 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  50.48 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  50.48 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.82 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.69 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.9 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.07 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.07 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.38 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.85 
 
 		 218 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  48.39 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  50.95 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  52.15 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  53.33 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  53.33 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  53.33 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.34 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  51.9 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  51.9 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.93 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 		 221 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  50.91 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  53.37 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.37 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.37 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.62 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>