More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0806 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 246 aa  471  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0932  putative ABC transporter permease protein  79.09 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1907  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  65.74 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3249  hypothetical protein  65.74 
 
 		 218 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  56.59 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.29 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  53.64 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  52.73 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 		 224 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  52.78 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.24 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  53.24 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.24 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  50.97 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  56.74 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  53.64 
 
 		 225 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.7 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  60.98 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.07 
 
 		 217 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  53.73 
 
 		 218 aa  195  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.73 
 
 		 218 aa  195  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 		 217 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  55.76 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.66 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  55.5 
 
 		 225 aa  193  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.38 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0459046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.83 
 
 		 222 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.69 
 
 		 213 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.45 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.56 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  56.65 
 
 		 223 aa  189  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  56.65 
 
 		 223 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.65 
 
 		 223 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.21 
 
 		 213 aa  188  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  54.42 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  52.34 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  54.42 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  52.34 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  54.42 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  54.42 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  54.42 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  54.42 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.19 
 
 		 218 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.19 
 
 		 218 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 		 221 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  53.77 
 
 		 217 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 		 225 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.63 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.83 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  52.48 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.95 
 
 		 214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.03 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 		 227 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 		 227 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.34 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.09 
 
 		 217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.88 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.15 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.7 
 
 		 227 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.5 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.89 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2337  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.09 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790204  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  50.23 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  50.23 
 
 		 217 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.8 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.65 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.38 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  54.68 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.68 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.56 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.8 
 
 		 214 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 		 221 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.76 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.84 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.23 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  51.4 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  61.02 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  61.02 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.51 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.6 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  59.89 
 
 		 217 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  58.76 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.19 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.19 
 
 		 217 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>