More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0130 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
224 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
224 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  98.21 
 
 
224 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.59 
 
 
224 aa  327  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.2 
 
 
228 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.04 
 
 
221 aa  276  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.64 
 
 
221 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.12 
 
 
222 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  68.66 
 
 
223 aa  265  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.52 
 
 
221 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.06 
 
 
221 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.65 
 
 
221 aa  260  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.44 
 
 
217 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.44 
 
 
217 aa  248  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3282  D- and L-methionine ABC transporter, permease protein  71.63 
 
 
221 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.334498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  64.52 
 
 
217 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.59 
 
 
221 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.57 
 
 
217 aa  238  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.81 
 
 
220 aa  237  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.23 
 
 
230 aa  235  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.13 
 
 
217 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.54 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.75 
 
 
217 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  58.06 
 
 
225 aa  232  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.13 
 
 
217 aa  232  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  61.17 
 
 
225 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  58.99 
 
 
225 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.37 
 
 
217 aa  230  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.99 
 
 
221 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  58.53 
 
 
225 aa  228  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.28 
 
 
221 aa  228  8e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.28 
 
 
221 aa  228  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.37 
 
 
221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.18 
 
 
221 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  63.37 
 
 
228 aa  221  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.48 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.02 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.61 
 
 
225 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  61.29 
 
 
217 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  59.6 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  59.6 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.35 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  59.91 
 
 
217 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.91 
 
 
217 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  60.83 
 
 
217 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  60.83 
 
 
217 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  60.83 
 
 
217 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  60.37 
 
 
217 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 
225 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  60.37 
 
 
217 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  60.37 
 
 
217 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  60.37 
 
 
217 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
217 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
217 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
217 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  50.48 
 
 
226 aa  208  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  60.37 
 
 
217 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.68 
 
 
233 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.2 
 
 
215 aa  204  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.02 
 
 
217 aa  204  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.53 
 
 
217 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.53 
 
 
217 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.24 
 
 
246 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  54.46 
 
 
213 aa  194  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  52.58 
 
 
221 aa  194  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  52.58 
 
 
221 aa  194  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.69 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.24 
 
 
223 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0459046  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  51.9 
 
 
225 aa  192  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.7 
 
 
221 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  60.49 
 
 
217 aa  191  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.76 
 
 
214 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.64 
 
 
223 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  55.24 
 
 
218 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.26 
 
 
214 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.6 
 
 
218 aa  188  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  53.77 
 
 
218 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  53.77 
 
 
218 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  53.77 
 
 
218 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  53.77 
 
 
218 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  53.77 
 
 
218 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  53.77 
 
 
218 aa  187  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.92 
 
 
214 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.76 
 
 
218 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.26 
 
 
214 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.26 
 
 
214 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.46 
 
 
214 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1907  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  59.56 
 
 
218 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  50.72 
 
 
237 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0877  DL-methionine transporter permease subunit  53.46 
 
 
217 aa  185  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000269148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.4 
 
 
218 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.4 
 
 
218 aa  185  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.75 
 
 
213 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  51.67 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  51.67 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  54.07 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 
220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3985  DL-methionine transporter permease subunit  50.69 
 
 
217 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  50.94 
 
 
217 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>