More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3574 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.12 
 
 		 227 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.02 
 
 		 227 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 		 235 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.02 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536263  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  46.15 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  48.54 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.71 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  45.21 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  44.19 
 
 		 217 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.86 
 
 		 225 aa  161  9e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  45.96 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  44.19 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  47.59 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.19 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  46.19 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  43.72 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.5 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  44.39 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  44.39 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  44.39 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  44.39 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  44.39 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  44.39 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.33 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1797  hypothetical protein  49.04 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.4 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  45.12 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  45.12 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  43.87 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1798  hypothetical protein  48.56 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.66 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  43.27 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  45.32 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2337  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.51 
 
 		 223 aa  148  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790204  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  41.9 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  41.9 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.36 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  44.08 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.08 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1907  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  48.37 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0459046  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.86 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  42.92 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  43.81 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 		 217 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  44.29 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.29 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.19 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3500  DL-methionine transporter permease subunit  44.92 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000072704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.77 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3343  DL-methionine transporter permease subunit  44.39 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  44.29 
 
 		 213 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 		 221 aa  141  6e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  42.58 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  38.77 
 
 		 224 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>