More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0252 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
225 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.17 
 
 
219 aa  291  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.89 
 
 
224 aa  261  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  64.44 
 
 
224 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  74.67 
 
 
224 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  73.61 
 
 
225 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  73.61 
 
 
225 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72 
 
 
223 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0113  ABC transporter, permease protein  72 
 
 
223 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975917  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72 
 
 
223 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337726  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.97 
 
 
222 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.97 
 
 
221 aa  246  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.56 
 
 
223 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00591896  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  61.47 
 
 
231 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  55.05 
 
 
235 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.05 
 
 
235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.87 
 
 
221 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.34 
 
 
217 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
222 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  52.68 
 
 
226 aa  203  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 
222 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.88 
 
 
217 aa  201  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
229 aa  201  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.88 
 
 
217 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.37 
 
 
217 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.37 
 
 
217 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.61 
 
 
225 aa  195  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  56.19 
 
 
218 aa  193  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  56.19 
 
 
218 aa  193  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.06 
 
 
224 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  54.68 
 
 
217 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 
224 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.41 
 
 
221 aa  187  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  48.85 
 
 
218 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  55.88 
 
 
217 aa  184  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 
221 aa  184  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.19 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.92 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.4 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.46 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.94 
 
 
221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 
225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.28 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.96 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.96 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
235 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.88 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  55.39 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.88 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.88 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.88 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 
217 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  50 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  50 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  55.88 
 
 
217 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  50 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 
217 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 
217 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  50 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 
217 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
217 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  50 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 
217 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 
217 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  50 
 
 
218 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.88 
 
 
217 aa  180  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.54 
 
 
224 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  52.48 
 
 
228 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.75 
 
 
215 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  49.75 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  49.75 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.74 
 
 
214 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  50.48 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  50.48 
 
 
221 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 
218 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 
246 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 
221 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.39 
 
 
217 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  47.09 
 
 
225 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.39 
 
 
217 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  50.97 
 
 
213 aa  175  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.74 
 
 
214 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  51.12 
 
 
224 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.29 
 
 
214 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.72 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  51.12 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.09 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.12 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
214 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  47.09 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.25 
 
 
217 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.36 
 
 
220 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.26 
 
 
214 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  49.52 
 
 
218 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>