More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1448 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 219 aa  423  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.17 
 
 		 225 aa  307  9e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.89 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  63.55 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  68.95 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  68.95 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.56 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.22 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.22 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00591896  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0113  ABC transporter, permease protein  68.22 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.22 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.89 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.87 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  55.96 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.94 
 
 		 222 aa  210  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  54.59 
 
 		 235 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.59 
 
 		 235 aa  208  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.22 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.28 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.66 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.96 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  49.27 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.66 
 
 		 217 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.03 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.66 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.51 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  53.09 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.09 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  48.15 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  50.5 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  48.33 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  48.33 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  51.94 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.25 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.85 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 		 218 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.76 
 
 		 235 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  52.25 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  49.51 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  52.25 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.25 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  52.45 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  53.08 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.74 
 
 		 214 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  48.78 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  48.78 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  49.5 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  48.78 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  49.5 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  51.02 
 
 		 228 aa  170  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  46.3 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  52.94 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  48.78 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  46.3 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  52.94 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  46.3 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  52.94 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  52.94 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.06 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.79 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  52.94 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  46.3 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  46.3 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  46.3 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.53 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  46.73 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  46.89 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  46.89 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.52 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  51.96 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  54.41 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  51.96 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  51.96 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  54.41 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 		 213 aa  169  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  54.41 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  54.41 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  54.41 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  54.41 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  54.41 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  54.41 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.25 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.24 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  48.33 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>