More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2418 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  100 
 
 
223 aa  426  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  68.66 
 
 
224 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.66 
 
 
224 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  68.2 
 
 
224 aa  259  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.09 
 
 
224 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.86 
 
 
221 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.03 
 
 
228 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.34 
 
 
222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.33 
 
 
221 aa  251  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.69 
 
 
221 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.77 
 
 
221 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70 
 
 
221 aa  237  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.67 
 
 
221 aa  235  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  63.59 
 
 
217 aa  232  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.67 
 
 
217 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.67 
 
 
217 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.95 
 
 
230 aa  225  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3282  D- and L-methionine ABC transporter, permease protein  68.16 
 
 
221 aa  225  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.334498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.35 
 
 
221 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.68 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.05 
 
 
213 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
221 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.26 
 
 
217 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  57.77 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  57.87 
 
 
225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.33 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.14 
 
 
223 aa  214  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  56.13 
 
 
225 aa  214  8e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.92 
 
 
221 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.92 
 
 
221 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  54.5 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  62.79 
 
 
225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.27 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  58.79 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.79 
 
 
218 aa  211  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.92 
 
 
221 aa  211  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.64 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.47 
 
 
217 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.24 
 
 
220 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  59.41 
 
 
228 aa  209  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.47 
 
 
221 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  50.67 
 
 
226 aa  209  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  55.66 
 
 
225 aa  208  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.04 
 
 
217 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 
224 aa  205  6e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.71 
 
 
217 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.05 
 
 
217 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  66.87 
 
 
217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  56.94 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  56.94 
 
 
217 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  58.57 
 
 
213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.22 
 
 
218 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  55.3 
 
 
221 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  55.3 
 
 
221 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  56.87 
 
 
218 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  56.87 
 
 
218 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  56.87 
 
 
218 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  56.87 
 
 
218 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  56.87 
 
 
218 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  56.87 
 
 
218 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  56.46 
 
 
218 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.66 
 
 
217 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  65.06 
 
 
217 aa  192  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.06 
 
 
217 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.06 
 
 
217 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.06 
 
 
217 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.38 
 
 
221 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  66.87 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  66.87 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  66.87 
 
 
217 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.5 
 
 
218 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  66.27 
 
 
217 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.59 
 
 
218 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.7 
 
 
246 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  66.27 
 
 
217 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.11 
 
 
214 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.78 
 
 
214 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.06 
 
 
217 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.59 
 
 
218 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.06 
 
 
217 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.73 
 
 
220 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  66.27 
 
 
217 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  66.27 
 
 
217 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.28 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  66.27 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.28 
 
 
214 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.46 
 
 
217 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.28 
 
 
214 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.77 
 
 
213 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  52.17 
 
 
237 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.09 
 
 
233 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  56.94 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  55.77 
 
 
218 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.28 
 
 
225 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.53 
 
 
222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0877  DL-methionine transporter permease subunit  52.86 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000269148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  55.07 
 
 
214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  54.07 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 
235 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.29 
 
 
218 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>