More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0858 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 222 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.84 
 
 		 222 aa  387  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.83 
 
 		 222 aa  348  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.97 
 
 		 221 aa  241  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0124248  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.52 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0112  ABC transporter, permease protein  66.52 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0198801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5128  ABC transporter, permease protein  66.52 
 
 		 221 aa  240  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5124  ABC transporter, permease protein  66.97 
 
 		 221 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0134076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5126  ABC transporter, permease protein  66.97 
 
 		 221 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0592267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5221  ABC transporter permease  67.42 
 
 		 221 aa  235  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.793852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5091  ABC transporter, permease protein  67.42 
 
 		 221 aa  235  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4854  ABC transporter permease  67.42 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4695  ABC transporter, permease  67.42 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00753221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4710  ABC transporter, permease  67.42 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.07 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00652878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3078  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.17 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0490  ABC transporter, permease protein  61.57 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.507412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.96 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000039198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.96 
 
 		 231 aa  191  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00842826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  49.55 
 
 		 231 aa  185  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  47.73 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.73 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  48.13 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  47.49 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  49.51 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.95 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.93 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  46.7 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.49 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  42.58 
 
 		 226 aa  164  9e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 		 217 aa  161  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.14 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  44.5 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.23 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.7 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  44.98 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.7 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.02 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  44.55 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.65 
 
 		 222 aa  157  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.54 
 
 		 217 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.23 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.79 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  49.01 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3985  DL-methionine transporter permease subunit  46.23 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  50.74 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0209  DL-methionine transporter permease subunit  46.41 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00265437  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00197  DL-methionine transporter subunit  46.41 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000504385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0205  DL-methionine transporter permease subunit  46.41 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000266103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0202  DL-methionine transporter permease subunit  46.41 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  49.5 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0210  DL-methionine transporter permease subunit  46.41 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3461  DL-methionine transporter permease subunit  46.41 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000136309  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.34 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00196  hypothetical protein  46.41 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000400781  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.26 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 		 246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  47.93 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  47.93 
 
 		 225 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.64 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0192  DL-methionine transporter permease subunit  46.41 
 
 		 217 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000747175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  46.23 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  47.06 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3343  DL-methionine transporter permease subunit  48.99 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000540247  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  42.33 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  42.33 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  42.33 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  42.33 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  42.33 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  44.14 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.95 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  45.02 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3500  DL-methionine transporter permease subunit  48.99 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000072704  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  42.33 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  47.29 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  42.33 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  47.52 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>