More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0854 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
218 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.25 
 
 
218 aa  384  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  82.11 
 
 
218 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  82.11 
 
 
218 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  82.11 
 
 
218 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  82.11 
 
 
218 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  82.11 
 
 
218 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  82.11 
 
 
218 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.73 
 
 
218 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.26 
 
 
218 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  79.26 
 
 
218 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  81.73 
 
 
218 aa  298  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.25 
 
 
218 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.25 
 
 
218 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.25 
 
 
218 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.37 
 
 
217 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  66.82 
 
 
214 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  67.92 
 
 
217 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  67.92 
 
 
217 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.89 
 
 
214 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.89 
 
 
214 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.51 
 
 
217 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.89 
 
 
214 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.42 
 
 
214 aa  257  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  68.2 
 
 
217 aa  255  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  66.36 
 
 
216 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  66.82 
 
 
214 aa  248  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.57 
 
 
220 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  61.29 
 
 
221 aa  244  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  61.29 
 
 
221 aa  244  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  65.89 
 
 
214 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
221 aa  241  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  62.67 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.07 
 
 
215 aa  230  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.13 
 
 
218 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.72 
 
 
221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.63 
 
 
217 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.26 
 
 
217 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.63 
 
 
217 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.37 
 
 
217 aa  218  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.02 
 
 
221 aa  217  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.48 
 
 
221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.48 
 
 
221 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  57.8 
 
 
217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.37 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60731  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.68 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.33 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  58.45 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.33 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.59 
 
 
230 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.45 
 
 
225 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.06 
 
 
217 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.76 
 
 
224 aa  205  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  60.19 
 
 
217 aa  203  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.22 
 
 
223 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  58.8 
 
 
217 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  51.71 
 
 
226 aa  202  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.13 
 
 
221 aa  201  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  51.16 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  51.16 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.22 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.22 
 
 
221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  55.45 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.23 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.33 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.41 
 
 
217 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 
222 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  58.33 
 
 
217 aa  195  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  56.94 
 
 
217 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  51.61 
 
 
225 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.59 
 
 
224 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.46 
 
 
223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.74 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.94 
 
 
217 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.94 
 
 
217 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.94 
 
 
217 aa  194  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.41 
 
 
217 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.41 
 
 
217 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.21 
 
 
221 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 
221 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  52.43 
 
 
225 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  55.24 
 
 
224 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  49.77 
 
 
225 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.33 
 
 
228 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.43 
 
 
225 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  55.24 
 
 
224 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.24 
 
 
224 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.76 
 
 
221 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 
225 aa  191  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  51.39 
 
 
225 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.89 
 
 
225 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  53.37 
 
 
223 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.37 
 
 
223 aa  185  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  53.37 
 
 
223 aa  185  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>