More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5612 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
223 aa  428  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  72.22 
 
 
217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.32 
 
 
217 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.91 
 
 
214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.75 
 
 
215 aa  225  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  58.88 
 
 
217 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  58.88 
 
 
217 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  60.83 
 
 
218 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  60.83 
 
 
218 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  60.83 
 
 
218 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  60.83 
 
 
218 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  60.83 
 
 
218 aa  218  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  60.83 
 
 
218 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.36 
 
 
220 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.6 
 
 
217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  57.8 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  57.8 
 
 
221 aa  211  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.49 
 
 
214 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.38 
 
 
218 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  58.62 
 
 
217 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.34 
 
 
221 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.22 
 
 
218 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.91 
 
 
214 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.55 
 
 
214 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  56.22 
 
 
218 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.96 
 
 
214 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.48 
 
 
218 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.48 
 
 
218 aa  205  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.08 
 
 
214 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.08 
 
 
214 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.69 
 
 
218 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.69 
 
 
218 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.69 
 
 
218 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  62.19 
 
 
218 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  57.55 
 
 
213 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  57.94 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  52.45 
 
 
218 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.45 
 
 
218 aa  193  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  49.03 
 
 
225 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.99 
 
 
218 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  48.82 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  49.76 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.19 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  47.6 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 
217 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 
217 aa  180  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 
227 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  52.45 
 
 
225 aa  179  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  47.12 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.21 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.66 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  51.98 
 
 
228 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.47 
 
 
217 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 
224 aa  177  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  50.48 
 
 
224 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 
225 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.93 
 
 
217 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60731  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
227 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1104  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.3 
 
 
219 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.08 
 
 
213 aa  175  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  49.32 
 
 
224 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.32 
 
 
224 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.92 
 
 
223 aa  174  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  45.59 
 
 
226 aa  171  6.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 
213 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
222 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  49.53 
 
 
217 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 
221 aa  168  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 
221 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.17 
 
 
221 aa  168  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.08 
 
 
217 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
236 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  48.11 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.58 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.58 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
217 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
217 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
217 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
217 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
217 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
217 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
217 aa  165  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 
224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  49.06 
 
 
217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
246 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.97 
 
 
223 aa  164  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  49.06 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.42 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.7 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>