More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1104 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1104  D-methionine ABC transporter, permease protein  100 
 
 
219 aa  429  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.6 
 
 
215 aa  208  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  53.59 
 
 
213 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  52.29 
 
 
221 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  52.29 
 
 
221 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.29 
 
 
221 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  50.69 
 
 
218 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  50.69 
 
 
218 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  50.69 
 
 
218 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  50.69 
 
 
218 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  50.69 
 
 
218 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  50.69 
 
 
218 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  46.08 
 
 
218 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
218 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 
218 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.23 
 
 
217 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.676084 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
217 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.49 
 
 
217 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60731  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  45.54 
 
 
217 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  45.54 
 
 
217 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.98 
 
 
218 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.98 
 
 
218 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.98 
 
 
218 aa  184  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  50.49 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.3 
 
 
223 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  43.38 
 
 
224 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  49.07 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.31 
 
 
220 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.87 
 
 
214 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  44.76 
 
 
226 aa  178  7e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
217 aa  177  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  42.92 
 
 
224 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
224 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
214 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
214 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  46.23 
 
 
217 aa  175  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
214 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
214 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.23 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.95 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  45.28 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.24 
 
 
223 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  43.72 
 
 
218 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  43.72 
 
 
218 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
224 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  44.13 
 
 
216 aa  168  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.5 
 
 
221 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.08 
 
 
221 aa  168  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
218 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.76 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
221 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  43.06 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  42.23 
 
 
225 aa  159  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
222 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
228 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
217 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
225 aa  158  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
217 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
221 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
236 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  40.67 
 
 
225 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.78 
 
 
225 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
222 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
221 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
217 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
217 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  41.47 
 
 
217 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
221 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
217 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.33 
 
 
224 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  38.71 
 
 
217 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
222 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00197  DL-methionine transporter subunit  39.63 
 
 
217 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000504385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
217 aa  149  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0202  DL-methionine transporter permease subunit  39.63 
 
 
217 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0205  DL-methionine transporter permease subunit  39.63 
 
 
217 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000266103  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0210  DL-methionine transporter permease subunit  39.63 
 
 
217 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147429  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00196  hypothetical protein  39.63 
 
 
217 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000400781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3461  DL-methionine transporter permease subunit  39.63 
 
 
217 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000136309  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  46.57 
 
 
217 aa  148  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
217 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0209  DL-methionine transporter permease subunit  39.17 
 
 
217 aa  148  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00265437  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
221 aa  148  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
230 aa  147  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  39.17 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  39.17 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  39.17 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  39.17 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  39.17 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0192  DL-methionine transporter permease subunit  39.63 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000747175  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  39.17 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0877  DL-methionine transporter permease subunit  40.09 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000269148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.4 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  38.71 
 
 
217 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  39.63 
 
 
217 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>