More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1588 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
235 aa  457  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.65 
 
 
205 aa  278  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 
227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
227 aa  238  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
227 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
227 aa  237  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0733  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536263  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  43.12 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  48.82 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  48.82 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.92 
 
 
214 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
217 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
224 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  44.98 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  48.92 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
218 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  47.85 
 
 
218 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  47.85 
 
 
218 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  47.85 
 
 
218 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  47.85 
 
 
218 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  47.85 
 
 
218 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  47.85 
 
 
218 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  44.08 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
217 aa  161  9e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  40.38 
 
 
217 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  44.28 
 
 
225 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
217 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.74 
 
 
214 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  44.17 
 
 
225 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
218 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
218 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.74 
 
 
214 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
218 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
215 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  36.57 
 
 
226 aa  159  4e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.84 
 
 
220 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  48.54 
 
 
217 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
221 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.24 
 
 
214 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
221 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
221 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.74 
 
 
214 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  45.81 
 
 
218 aa  155  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
217 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
225 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
217 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.32 
 
 
218 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
223 aa  152  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43 
 
 
213 aa  151  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
221 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.13 
 
 
217 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  44.86 
 
 
221 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  44.86 
 
 
221 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 
217 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.19 
 
 
217 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  46.89 
 
 
216 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
218 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  41.75 
 
 
218 aa  148  9e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.93 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  43.81 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
223 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  40.09 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.06 
 
 
221 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
230 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  45.67 
 
 
214 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2680  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
218 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
224 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
221 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43 
 
 
224 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
236 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
224 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  44.23 
 
 
213 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
246 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.67 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
235 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
225 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
217 aa  138  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
217 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
228 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
217 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
213 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
217 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
217 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 
217 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
217 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
217 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
217 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
224 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>