More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4597 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
221 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.18 
 
 
220 aa  335  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2106  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.21 
 
 
228 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.21 
 
 
227 aa  194  6e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.780286 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1823  ABC methionine transporter, ATPase subunit MetI  54.5 
 
 
228 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.494642  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.09 
 
 
217 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.58 
 
 
221 aa  185  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.58 
 
 
221 aa  185  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.49 
 
 
221 aa  184  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  53.74 
 
 
217 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.13 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.77 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  52.6 
 
 
225 aa  178  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.91 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  48.1 
 
 
224 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.1 
 
 
224 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.15 
 
 
225 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
225 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.87 
 
 
219 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 
224 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
235 aa  174  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.68 
 
 
221 aa  174  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  50.49 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  48.56 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  46.31 
 
 
226 aa  173  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  48.56 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.49 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.32 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  51.4 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.65 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  48.56 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.11 
 
 
217 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.11 
 
 
217 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.34 
 
 
220 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.34 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  48.08 
 
 
222 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  50.23 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  50.23 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  51.4 
 
 
224 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  50.23 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  50.23 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  50.23 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  50.23 
 
 
218 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
224 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
218 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
230 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 
218 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.72 
 
 
213 aa  168  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 
228 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 
221 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
219 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.970638  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.26 
 
 
215 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 
222 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 
222 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
219 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.47 
 
 
219 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  45.41 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  48.83 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.71 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.71 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
227 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.87 
 
 
227 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.09 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.64 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.34 
 
 
221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  46.48 
 
 
217 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 
222 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.03 
 
 
213 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  46.48 
 
 
217 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.56 
 
 
222 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 
222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0576  ABC transporter integral membrane protein  53.27 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.332702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  44.83 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0566  ABC transporter integral membrane protein  53.27 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0620  ABC transporter integral membrane protein  53.27 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0561  ABC transporter integral membrane protein  53.27 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0559  ABC transporter integral membrane protein  53.27 
 
 
219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.64 
 
 
217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 
222 aa  161  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.4 
 
 
222 aa  161  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.83 
 
 
221 aa  161  6e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 
221 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 
225 aa  161  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  45.32 
 
 
225 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
221 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  46.15 
 
 
221 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  47.6 
 
 
222 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  51.98 
 
 
218 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  51.13 
 
 
225 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.98 
 
 
218 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.98 
 
 
218 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.98 
 
 
218 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.8 
 
 
221 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.55 
 
 
222 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.01 
 
 
217 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
220 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 
221 aa  154  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>