More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1541 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  56.87 
 
 		 213 aa  208  7e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  54.4 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  55.05 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.64 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  51.01 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.88 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  54.13 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.54 
 
 		 224 aa  199  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.67 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.54 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0643  ABC transporter, permease protein  52.94 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.766537  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  53.02 
 
 		 223 aa  184  9e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.23 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.23 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.35 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.23 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  48.85 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  50 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  49.53 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  49.48 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 		 222 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  50.7 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  49.07 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.51 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.62 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  55.08 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  53.81 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  48.4 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  49.75 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.74 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.74 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.74 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.74 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.51 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.74 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.26 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  51.24 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.24 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.24 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.24 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.77 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  50.77 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.25 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713567  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1019  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  51.74 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.32 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1239  ABC transporter, permease protein  48.22 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0864  ABC transporter, permease protein  48.22 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.586541  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0794  ABC transporter, permease protein  48.22 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.485222  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.76 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  46.57 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  46.57 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  46.57 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000249965  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.79 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3282  D- and L-methionine ABC transporter, permease protein  52 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.334498 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.96 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000207474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3249  hypothetical protein  50.27 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  51.78 
 
 		 221 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  51.78 
 
 		 221 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.76 
 
 		 219 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  46.08 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  51.7 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  51.7 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  51.7 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.6 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  51.14 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  50 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.44 
 
 		 217 aa  158  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.58 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.14 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  46.19 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1798  hypothetical protein  50.24 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  46.19 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3461  DL-methionine transporter permease subunit  51.14 
 
 		 217 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000136309  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  46.19 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  46.19 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>