More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3767 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 221 aa  421  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.97 
 
 		 225 aa  281  5.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  75.81 
 
 		 225 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  75.81 
 
 		 225 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  65.58 
 
 		 224 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  64.98 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  63.93 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.89 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  73.95 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.51 
 
 		 222 aa  234  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.95 
 
 		 223 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00591896  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.49 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0113  ABC transporter, permease protein  73.49 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.49 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.8 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  57.8 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.92 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.7 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.67 
 
 		 224 aa  207  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.52 
 
 		 221 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.46 
 
 		 222 aa  204  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.61 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.53 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.53 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  53.24 
 
 		 217 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.17 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  51.23 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.97 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  50.69 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  52.88 
 
 		 218 aa  194  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.88 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  50.23 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  50.23 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  50.23 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.88 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  50.23 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.88 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  50.23 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  50.23 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.19 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.11 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  52.43 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  52.43 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.66 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  52.68 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.72 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.83 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.2 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  47.03 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  47.03 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.22 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  51.49 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 		 246 aa  184  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  51.46 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.22 
 
 		 221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.24 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.23 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  47.96 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  47.96 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  51.98 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  51.98 
 
 		 218 aa  181  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.51 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  52.17 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.04 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  48.31 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  56.18 
 
 		 217 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  51.69 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.69 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.45 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.81 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.96 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.06 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.72 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  53.62 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  49.01 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  47.96 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  47.96 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2979  ABC transporter, membrane permease  53.62 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1651  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2869  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2930  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0413  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0216  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  48.36 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1907  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  55.5 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166968 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2557  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0933  D-methionine ABC transporter, permease protein  53.62 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>