More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03094 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  100 
 
 
231 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  77.78 
 
 
235 aa  327  6e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.78 
 
 
235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0083693  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.25 
 
 
229 aa  278  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529248  normal  0.672629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.47 
 
 
225 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5261  D-methionine ABC transporter, permease protein  58.56 
 
 
224 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0282  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.56 
 
 
224 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.93 
 
 
221 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.713286  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6305  ABC transporter permease  60 
 
 
225 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72630  putative permease of ABC transporter  60 
 
 
225 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.36 
 
 
222 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.81 
 
 
223 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0851802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0066  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.71 
 
 
224 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0113  ABC transporter, permease protein  60.81 
 
 
223 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975917  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.55 
 
 
222 aa  205  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.81 
 
 
223 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.337726  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.81 
 
 
223 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00591896  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.57 
 
 
222 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.96 
 
 
219 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.388698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
225 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  46.93 
 
 
226 aa  186  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  52.2 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  52.2 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  51.71 
 
 
222 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  51.31 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 
224 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.76 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.03 
 
 
217 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.2 
 
 
222 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  50.98 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  52.2 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  49.28 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  50.98 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  49.28 
 
 
217 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  51.71 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.28 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 
230 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.45 
 
 
221 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.28 
 
 
217 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 
217 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  49.54 
 
 
217 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.28 
 
 
223 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  50.73 
 
 
222 aa  168  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.11 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.28 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  47.87 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  47.87 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  47.87 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  47.87 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.01 
 
 
214 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  47.87 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  47.87 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.75 
 
 
225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  44.6 
 
 
218 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.76 
 
 
213 aa  161  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  45.63 
 
 
225 aa  161  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.99 
 
 
213 aa  161  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.26 
 
 
214 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  43.38 
 
 
225 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.6 
 
 
218 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  48.79 
 
 
213 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  50.72 
 
 
216 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  45.63 
 
 
225 aa  158  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  46.86 
 
 
214 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5124  ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 
221 aa  158  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0134076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.74 
 
 
214 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.36 
 
 
221 aa  158  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5126  ABC transporter, permease protein  47.25 
 
 
221 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0592267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.32 
 
 
221 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  50.56 
 
 
224 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.26 
 
 
221 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  46.95 
 
 
224 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  47.4 
 
 
228 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  54.32 
 
 
217 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
221 aa  156  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  46.98 
 
 
224 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
225 aa  155  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0349  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.38 
 
 
214 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0321773  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.89 
 
 
217 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0312  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  47.78 
 
 
218 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
215 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
221 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.478156  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
221 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.74 
 
 
221 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.74 
 
 
221 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  50.56 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782482  normal  0.823992 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.808195  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.56 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0112  ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 
221 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0198801  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5128  ABC transporter, permease protein  46.79 
 
 
221 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>