More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1798 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1798  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  419  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1797  hypothetical protein  98.6 
 
 
215 aa  414  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.39 
 
 
225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  52.97 
 
 
218 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  52.97 
 
 
218 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  51.2 
 
 
226 aa  202  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.46 
 
 
224 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  51.92 
 
 
225 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  55.22 
 
 
228 aa  197  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  51.71 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  52.4 
 
 
225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  52.4 
 
 
225 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.4 
 
 
217 aa  192  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  54.15 
 
 
225 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
217 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.47 
 
 
217 aa  191  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.3 
 
 
213 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.07 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.56 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.56 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.81 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.56 
 
 
227 aa  188  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  54.17 
 
 
217 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3500  DL-methionine transporter permease subunit  56.02 
 
 
217 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000072704  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  52.91 
 
 
223 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 
215 aa  186  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  49.77 
 
 
223 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  49.77 
 
 
223 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.57 
 
 
224 aa  186  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 
223 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3343  DL-methionine transporter permease subunit  55.56 
 
 
217 aa  185  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000540247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.72 
 
 
217 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.64 
 
 
224 aa  184  8e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 
221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.6 
 
 
227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  50.24 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0846  DL-methionine transporter permease subunit  54.63 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000145183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.47 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.24 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  53.24 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.76 
 
 
225 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00197  DL-methionine transporter subunit  53.24 
 
 
217 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000504385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.24 
 
 
217 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3461  DL-methionine transporter permease subunit  53.24 
 
 
217 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000136309  normal  0.862473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0205  DL-methionine transporter permease subunit  53.24 
 
 
217 aa  180  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000266103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0202  DL-methionine transporter permease subunit  53.24 
 
 
217 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000439538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0209  DL-methionine transporter permease subunit  53.24 
 
 
217 aa  180  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00265437  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00196  hypothetical protein  53.24 
 
 
217 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000400781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0210  DL-methionine transporter permease subunit  53.24 
 
 
217 aa  180  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147429  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0192  DL-methionine transporter permease subunit  53.24 
 
 
217 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000747175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.47 
 
 
221 aa  179  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
221 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 
213 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  53.99 
 
 
221 aa  179  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.393989  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.99 
 
 
221 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.48 
 
 
228 aa  177  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0877  DL-methionine transporter permease subunit  53.7 
 
 
217 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000269148  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.52 
 
 
221 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.72 
 
 
214 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2337  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.62 
 
 
223 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790204  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  48.15 
 
 
218 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2431  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  54.15 
 
 
237 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0101713  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.15 
 
 
218 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.24 
 
 
235 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  50 
 
 
224 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.58 
 
 
214 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.58 
 
 
214 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.58 
 
 
214 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  50.46 
 
 
217 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.58 
 
 
214 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  46.76 
 
 
218 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  46.76 
 
 
218 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  46.76 
 
 
218 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  46.76 
 
 
218 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  46.76 
 
 
218 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  46.76 
 
 
218 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 
221 aa  174  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.84 
 
 
221 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  51.47 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.84 
 
 
221 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.47 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3985  DL-methionine transporter permease subunit  51.85 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.273342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  51.16 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  52.83 
 
 
213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.77 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.206806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.8 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116542  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  49.52 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  49.52 
 
 
217 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>