More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2761 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
223 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0696244  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10520  ABC-type metal ion transport system, permease component  65.02 
 
 
226 aa  224  6e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0298232  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.76 
 
 
215 aa  193  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  54.68 
 
 
218 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  54.68 
 
 
218 aa  192  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.05 
 
 
224 aa  191  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  51.64 
 
 
225 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  54.11 
 
 
225 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  52.17 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.85 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  52.58 
 
 
225 aa  188  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.69 
 
 
217 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.69 
 
 
217 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.47 
 
 
222 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  51.23 
 
 
228 aa  184  8e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 
213 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.54 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  46.19 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  52.17 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.93 
 
 
221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.37 
 
 
217 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0812331  hitchhiker  0.00268015 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7235  ABC transporter membrane spanning protein  51.16 
 
 
217 aa  181  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  49.02 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  49.04 
 
 
224 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.37 
 
 
217 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  49.04 
 
 
224 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 
224 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  51.43 
 
 
217 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
227 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
246 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.11 
 
 
217 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.78 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0134414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  49.33 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2660  ABC transporter, permease protein  52.45 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.45 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396417  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1548  ABC transporter permease  52.45 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0459046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.04 
 
 
213 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0235  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.14 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.15851  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.07 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.07 
 
 
221 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.11 
 
 
221 aa  171  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2911  ABC transporter permease  46.54 
 
 
217 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
217 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
221 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34260  putative permease of ABC transporter  46.54 
 
 
217 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0163975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4993  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.5 
 
 
214 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.571534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
227 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.77 
 
 
221 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.24 
 
 
221 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.44 
 
 
221 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.24 
 
 
221 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
227 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
227 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
218 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141892  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.39 
 
 
217 aa  168  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0441885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 
214 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.113433  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
222 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
224 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.15 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 
228 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0789  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.69 
 
 
225 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  49.52 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  49.52 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  49.52 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  49.52 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0252  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.73 
 
 
225 aa  164  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.302856  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  49.52 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  49.52 
 
 
218 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.52 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290196  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0234  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47 
 
 
214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.6 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31530  transmembrane ABC transporter protein  49.31 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
221 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.22 
 
 
221 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.48 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 
222 aa  161  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
223 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1907  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  56.19 
 
 
218 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.166968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3249  hypothetical protein  52.66 
 
 
218 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.436126  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.59 
 
 
235 aa  158  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3754  DL-methionine transporter permease subunit  47.14 
 
 
217 aa  158  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000523808  normal  0.0802818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3406  DL-methionine transporter permease subunit  48.1 
 
 
217 aa  158  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.139854  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1095  DL-methionine transporter permease subunit  48.1 
 
 
217 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0123731  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1042  DL-methionine transporter permease subunit  48.1 
 
 
217 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000294871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0996  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  52.88 
 
 
217 aa  157  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  48.1 
 
 
217 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0674799  normal  0.269155 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0736  DL-methionine transporter permease subunit  48.08 
 
 
217 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00465748  normal  0.854328 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  45.24 
 
 
221 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5189  D-methionine ABC transporter, permease protein  47.14 
 
 
214 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  45.24 
 
 
221 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0287  DL-methionine transporter permease subunit  48.1 
 
 
217 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000127237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0268  DL-methionine transporter permease subunit  48.1 
 
 
217 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0411312  normal  0.568834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0284  DL-methionine transporter permease subunit  48.1 
 
 
217 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00293716  normal  0.232369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0273  DL-methionine transporter permease subunit  48.1 
 
 
217 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188598  normal  0.044434 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  47.14 
 
 
213 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.98 
 
 
217 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>