More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1055 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1055  ABC-type metal ion transport system, permease component  100 
 
 
228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0162881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0366  ABC-type metal ion transport system, permease component  54.02 
 
 
231 aa  208  7e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0191  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.21 
 
 
229 aa  202  4e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.799852  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1721  ABC-type metal ion transport system, permease component  45.09 
 
 
232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0427  ABC-type metal ion transport system, permease component  53.95 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.43 
 
 
226 aa  189  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0275  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.97 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0343  ABC-type metal ion transport system, permease component  49.12 
 
 
230 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000324678  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0890  ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000286975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.75 
 
 
224 aa  172  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000432369 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08270  ABC-type metal ion transport system, permease component  42.44 
 
 
225 aa  169  3e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154439  normal  0.55012 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0846  ABC-type metal ion transport system, permease component  49.57 
 
 
233 aa  168  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883508  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
226 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
222 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.58 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.918282  hitchhiker  0.000827956 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1249  putative ABC transporter, permease protein  48.51 
 
 
224 aa  160  1e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.85 
 
 
217 aa  158  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000122974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
226 aa  158  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2653  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
224 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0196  D-methionine ABC transporter, permease protein  40 
 
 
218 aa  158  6e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2000  methionine transport system permease protein  40 
 
 
218 aa  158  6e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0098  ABC transporter, permease protein  45.97 
 
 
219 aa  157  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.712322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
236 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1074  D-methionine transport system permease protein MetI  47.52 
 
 
224 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0968  D-methionine transport system permease protein MetI  44.93 
 
 
213 aa  155  6e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4332  hypothetical protein  40.38 
 
 
224 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.362545  normal  0.101939 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1638  ABC transporter, permease protein  46.96 
 
 
230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0438642  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0130  ABC D-methionine uptake transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
224 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1767  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
224 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0577553  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004239  methionine ABC transporter permease protein  42.03 
 
 
225 aa  148  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
230 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481635  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0643  ABC transporter, permease protein  44.63 
 
 
221 aa  148  8e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.766537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19580  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.66 
 
 
222 aa  147  9e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0175  ABC transporter permease  44.17 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.713408  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16990  ABC-type metal ion transport system, permease component  44.02 
 
 
217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.126358  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0173  ABC transporter permease  44.17 
 
 
222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.560116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01201  hypothetical protein  40.98 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0194  ABC transporter, permease protein  44.17 
 
 
222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0887  D-methionine transport system permease protein MetI  39.42 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.23 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0165  ABC transporter, permease  43.69 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
217 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  normal  0.49182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
217 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.302745  normal  0.367632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
215 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.771315  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
219 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000249965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
219 aa  142  3e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000207474  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
235 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.104084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0921  transmembrane ABC transporter protein  41.35 
 
 
217 aa  141  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773713  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
224 aa  141  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0217  ABC transporter, permease protein  43.69 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626863  hitchhiker  0.00236834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1343  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.39 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0459046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0428  ABC transporter, permease protein  39.05 
 
 
225 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0195  ABC transporter, permease protein  43.2 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00533098  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1234  D-methionine transport system permease protein MetI  45.19 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
217 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0197  ABC transporter, permease protein  43.2 
 
 
222 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0962  ABC transporter, permease protein  43.66 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.496997  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0903  ABC transporter, permease protein  43.66 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571471  hitchhiker  0.00153184 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
222 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.6 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
221 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5128  ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
222 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
219 aa  137  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
227 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
227 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.129763 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
221 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.251109  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03094  ABC transporter permease  40.19 
 
 
231 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2418  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.29 
 
 
223 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3537  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  43.14 
 
 
228 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0228117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3885  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
227 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
227 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2537  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.38 
 
 
221 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00567563  normal  0.226034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7231  ABC transporter membrane spanning protein  44 
 
 
213 aa  134  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.238623  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.58 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.250327  normal  0.570083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2629  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2368  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0543007  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3857  DL-methionine transporter subunit  38.86 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.955348 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1975  ABC transporter permease protein  36.41 
 
 
235 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00271099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2552  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.87 
 
 
217 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0864  ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
303 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.586541  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1239  ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
303 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4173  ABC metal ion transporter, inner membrane subunit  40.87 
 
 
217 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325664  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0794  ABC transporter, permease protein  43.81 
 
 
303 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.485222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
217 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.464419  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.56 
 
 
246 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0936  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.35 
 
 
217 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0449  methionine ABC transporter permease  39.23 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.800882  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1438  ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.455899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1868  ABC transporter, permease protein  39.23 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0854  ABC methionine transporter, inner membrane subunit  40.67 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0225125  hitchhiker  0.00619599 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0859  methionine ABC transporter permease  39.23 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2175  methionine ABC transporter permease  39.23 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0547  methionine ABC transporter permease  39.23 
 
 
218 aa  131  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>